More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11930 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  100 
 
 
430 aa  860    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  73.05 
 
 
422 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  72.75 
 
 
421 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  72.75 
 
 
421 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  72.27 
 
 
421 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  72.81 
 
 
422 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  58.68 
 
 
447 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  57.07 
 
 
426 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  52.66 
 
 
434 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  33.73 
 
 
401 aa  243  5e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  36.18 
 
 
415 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  34.03 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  37.65 
 
 
414 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  36.69 
 
 
414 aa  230  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  34.58 
 
 
408 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  35.36 
 
 
419 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  34.58 
 
 
408 aa  227  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  37.18 
 
 
414 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  36.68 
 
 
420 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  34.97 
 
 
415 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  37.35 
 
 
420 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  34.66 
 
 
400 aa  223  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  35.87 
 
 
408 aa  223  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  38.04 
 
 
420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  32.95 
 
 
412 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  32.26 
 
 
412 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  34.19 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  37.56 
 
 
413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  34.49 
 
 
415 aa  212  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  33.72 
 
 
413 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  36 
 
 
413 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  33.49 
 
 
411 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  34.11 
 
 
413 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  35.15 
 
 
425 aa  210  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  34.91 
 
 
424 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  35.63 
 
 
424 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  34.99 
 
 
424 aa  209  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  34.68 
 
 
424 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  34.92 
 
 
425 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  36.34 
 
 
424 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  35.63 
 
 
424 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  34.95 
 
 
430 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  36.34 
 
 
424 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  34.68 
 
 
425 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  35.73 
 
 
414 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  33.72 
 
 
416 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  35.23 
 
 
437 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  33.97 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  33.49 
 
 
416 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  33.03 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  34.2 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  35.7 
 
 
425 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.88 
 
 
430 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  35.09 
 
 
418 aa  197  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  35.2 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  34.89 
 
 
424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  34.59 
 
 
424 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  32.56 
 
 
416 aa  196  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  34.03 
 
 
413 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  34.29 
 
 
416 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  33.1 
 
 
417 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  36.43 
 
 
413 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  33.64 
 
 
424 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  32.63 
 
 
411 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  34.54 
 
 
418 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  33.18 
 
 
423 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
424 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.8 
 
 
424 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  34.63 
 
 
432 aa  193  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  37.11 
 
 
419 aa  192  9e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  36.93 
 
 
408 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  33.56 
 
 
412 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  32.74 
 
 
418 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  32.71 
 
 
415 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  34.43 
 
 
424 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  32.99 
 
 
430 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  29.02 
 
 
403 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  33.11 
 
 
420 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  37.29 
 
 
408 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.7 
 
 
433 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  34.52 
 
 
417 aa  186  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  28.9 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  37.05 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  38.63 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  30.47 
 
 
416 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  30.66 
 
 
424 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  30.28 
 
 
406 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  33.1 
 
 
417 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.94 
 
 
429 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  32.89 
 
 
431 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  29.14 
 
 
412 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  29.37 
 
 
412 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  32.74 
 
 
423 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  35.99 
 
 
419 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  35.78 
 
 
420 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  29.14 
 
 
412 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  29.14 
 
 
412 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  29.14 
 
 
412 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  29.37 
 
 
412 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  29.14 
 
 
412 aa  176  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>