More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0265 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 
430 aa  865    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  63.72 
 
 
420 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  57.52 
 
 
418 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  58.1 
 
 
429 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  54.8 
 
 
423 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  55.37 
 
 
423 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  52.27 
 
 
431 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  41.36 
 
 
423 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  40.29 
 
 
423 aa  259  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  39.39 
 
 
415 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  39.05 
 
 
417 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  37.95 
 
 
411 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  37.38 
 
 
418 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  34.91 
 
 
413 aa  249  8e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  38.53 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  36.46 
 
 
415 aa  242  7.999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  35.86 
 
 
411 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  36.53 
 
 
417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 
412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  36.14 
 
 
418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  36.54 
 
 
414 aa  233  6e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  33.1 
 
 
412 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  38.26 
 
 
415 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  38.06 
 
 
413 aa  227  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  37.74 
 
 
414 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  36.24 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  37.24 
 
 
416 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  37.11 
 
 
413 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  37.82 
 
 
424 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  36.62 
 
 
424 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  36.79 
 
 
424 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  37.66 
 
 
425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  36.1 
 
 
425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  34.11 
 
 
413 aa  216  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  38.06 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  36.53 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  36.53 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  36.46 
 
 
424 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  37.1 
 
 
414 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  36.27 
 
 
424 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  36.53 
 
 
420 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33.81 
 
 
408 aa  210  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  36.2 
 
 
424 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  36.32 
 
 
419 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  35.14 
 
 
437 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  36.22 
 
 
415 aa  209  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  35.54 
 
 
408 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  35.94 
 
 
424 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  34.95 
 
 
430 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  35.05 
 
 
424 aa  208  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  35.94 
 
 
424 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  33.72 
 
 
443 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  35.58 
 
 
424 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  33.56 
 
 
420 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  35.05 
 
 
408 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  34.64 
 
 
416 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  34.64 
 
 
416 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  35.62 
 
 
408 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  37.89 
 
 
413 aa  203  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  37.08 
 
 
416 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  35.79 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  35.53 
 
 
408 aa  201  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  34.64 
 
 
424 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  35.15 
 
 
413 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  35.79 
 
 
410 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  33.25 
 
 
412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  33.25 
 
 
412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  33.25 
 
 
412 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  33.25 
 
 
412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  30.92 
 
 
401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  33.25 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  33.25 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  33.6 
 
 
425 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  33.85 
 
 
412 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  32.55 
 
 
411 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  32.98 
 
 
412 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  32.98 
 
 
412 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  35.36 
 
 
424 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  32.02 
 
 
415 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  37.18 
 
 
417 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  34.11 
 
 
424 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  32.72 
 
 
412 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  35.36 
 
 
414 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  30.5 
 
 
412 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  32.83 
 
 
424 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  35.95 
 
 
414 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.94 
 
 
433 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  36.49 
 
 
426 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  32.72 
 
 
400 aa  188  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  37.18 
 
 
433 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  30.62 
 
 
408 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.89 
 
 
430 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  37.76 
 
 
420 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  35.68 
 
 
418 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  32.63 
 
 
430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  35.64 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  34.26 
 
 
421 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  34.26 
 
 
421 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  34.6 
 
 
423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  34.26 
 
 
421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>