More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2558 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 420 aa  833    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  50.12 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  47.67 
 
 		 413 aa  372  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  49.4 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  45.97 
 
 		 413 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  49.64 
 
 		 421 aa  361  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  48.32 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  48.08 
 
 		 416 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 411 aa  356  5e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  45.06 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  48.52 
 
 		 416 aa  353  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  49.39 
 
 		 432 aa  348  8e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  48.2 
 
 		 416 aa  348  8e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  48.99 
 
 		 429 aa  348  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  48.3 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  45.23 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  45.99 
 
 		 412 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  48.17 
 
 		 419 aa  345  7e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  47.94 
 
 		 419 aa  343  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  45.74 
 
 		 412 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  46.38 
 
 		 413 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.45 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  44.31 
 
 		 415 aa  339  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.72 
 
 		 431 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.11 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  43.72 
 
 		 412 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  44.74 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  43.72 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  43.48 
 
 		 412 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  51.56 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  43.24 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.69 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  43.48 
 
 		 412 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  43.48 
 
 		 412 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  46.38 
 
 		 414 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  43.48 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  43.48 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  43.72 
 
 		 413 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  42.21 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  42.75 
 
 		 412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  42.27 
 
 		 412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.25 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  44.44 
 
 		 420 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  41.01 
 
 		 430 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  41.16 
 
 		 412 aa  309  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  44.39 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  40.05 
 
 		 415 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  41.85 
 
 		 420 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  39.47 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  48.95 
 
 		 423 aa  292  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  45.52 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  40.62 
 
 		 419 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  40.05 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  44.07 
 
 		 414 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  39.14 
 
 		 418 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  36.43 
 
 		 415 aa  282  8.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  42.05 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  43.58 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  43.9 
 
 		 413 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  38.61 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  41.87 
 
 		 437 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  42.67 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  43.28 
 
 		 427 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  42.67 
 
 		 408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  43.77 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  44.47 
 
 		 410 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  45.18 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  38.29 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  38.29 
 
 		 425 aa  266  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  38.29 
 
 		 425 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  41.9 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  38.3 
 
 		 417 aa  262  8.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  40.05 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  40.53 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  41.5 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  38.95 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  41.22 
 
 		 418 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  37.71 
 
 		 418 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  39.17 
 
 		 424 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  41.38 
 
 		 423 aa  259  7e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  36.6 
 
 		 408 aa  259  7e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  36.1 
 
 		 424 aa  259  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  37.56 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  37.38 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  44.66 
 
 		 433 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  43.17 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  37.86 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  38.11 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  37.32 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  38.11 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  37.77 
 
 		 424 aa  255  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  37.86 
 
 		 424 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  37.29 
 
 		 415 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  37.83 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  38.01 
 
 		 424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  37.59 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  35.19 
 
 		 424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  36.56 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  35.1 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  33.49 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>