More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1922 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  100 
 
 
411 aa  835    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  50.24 
 
 
413 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  52.91 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  50.24 
 
 
415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  45.12 
 
 
415 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  45.57 
 
 
411 aa  346  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  44.12 
 
 
411 aa  340  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  47.07 
 
 
413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  43.13 
 
 
415 aa  326  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  43.8 
 
 
413 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  40.63 
 
 
412 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.58 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  40.39 
 
 
412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  42.03 
 
 
416 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  40.78 
 
 
414 aa  289  6e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  40.29 
 
 
432 aa  288  9e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  39.37 
 
 
414 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  40.05 
 
 
420 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  40.19 
 
 
417 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  40.44 
 
 
412 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  39.47 
 
 
425 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  37.47 
 
 
419 aa  280  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  40.43 
 
 
438 aa  279  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  39.86 
 
 
433 aa  279  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  40.59 
 
 
412 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  40.1 
 
 
421 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  40.79 
 
 
412 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  40.35 
 
 
412 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  40.35 
 
 
412 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  40.35 
 
 
412 aa  276  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  41.22 
 
 
412 aa  275  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  40.35 
 
 
412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  39.26 
 
 
427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  40.96 
 
 
425 aa  272  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  40.35 
 
 
412 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  40.35 
 
 
412 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  41.11 
 
 
412 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  40 
 
 
418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  41.41 
 
 
414 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  38.26 
 
 
416 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  39.46 
 
 
406 aa  265  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  39.18 
 
 
416 aa  262  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  38.65 
 
 
416 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  38.74 
 
 
416 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  38.66 
 
 
432 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.09 
 
 
424 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.1 
 
 
429 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  36.2 
 
 
420 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.69 
 
 
433 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 
420 aa  256  4e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.57 
 
 
408 aa  256  7e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  39.23 
 
 
413 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  39.79 
 
 
417 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.23 
 
 
431 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  36.08 
 
 
423 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  37.29 
 
 
414 aa  246  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  36.12 
 
 
415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  35.32 
 
 
416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  36.63 
 
 
423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  32.93 
 
 
424 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  36.97 
 
 
408 aa  242  7e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  37.05 
 
 
413 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  36.96 
 
 
414 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  36.97 
 
 
408 aa  242  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  36.43 
 
 
408 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  34.3 
 
 
418 aa  239  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  37.86 
 
 
423 aa  238  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  37.62 
 
 
408 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.83 
 
 
424 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  37.37 
 
 
419 aa  236  4e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  34.77 
 
 
415 aa  236  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  38.15 
 
 
423 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.25 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  32.99 
 
 
430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  35.99 
 
 
419 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  34.76 
 
 
437 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  37.16 
 
 
408 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 
410 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  36.79 
 
 
412 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  36.75 
 
 
408 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  35.63 
 
 
414 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  36.65 
 
 
413 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  35.59 
 
 
443 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  34.87 
 
 
401 aa  228  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.36 
 
 
429 aa  226  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  35.09 
 
 
423 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
401 aa  225  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  33.65 
 
 
424 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  36.14 
 
 
431 aa  222  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  34.82 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  34.51 
 
 
415 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  37.97 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  32.93 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  32.78 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  36.3 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  36.79 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  32.93 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  36.79 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  32.68 
 
 
425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>