More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4280 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  74.53 
 
 		 424 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 424 aa  865    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  74.06 
 
 		 424 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  74.76 
 
 		 424 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  75 
 
 		 424 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  74.53 
 
 		 424 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  74.53 
 
 		 425 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  74.76 
 
 		 425 aa  667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  73.58 
 
 		 424 aa  646    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  86.79 
 
 		 424 aa  768    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  74.76 
 
 		 425 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  75 
 
 		 424 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  75.94 
 
 		 424 aa  667    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  74.53 
 
 		 424 aa  663    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  70.28 
 
 		 424 aa  621  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  70.28 
 
 		 424 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  42.62 
 
 		 397 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  41.63 
 
 		 398 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  41.63 
 
 		 398 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  41.63 
 
 		 398 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  41.39 
 
 		 398 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  41.39 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  41.19 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  41.19 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  41.19 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  41.19 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  41.19 
 
 		 400 aa  280  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  50.88 
 
 		 400 aa  278  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  40.95 
 
 		 400 aa  278  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  40.71 
 
 		 413 aa  277  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  40.19 
 
 		 417 aa  275  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  40.86 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  49.82 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  41.79 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 397 aa  269  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  48.58 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  37.86 
 
 		 420 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  39.08 
 
 		 413 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  39.32 
 
 		 413 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  48.23 
 
 		 397 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  36.67 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  40.24 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  40.49 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.44 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  37.59 
 
 		 415 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  36.06 
 
 		 423 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  36.75 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  37.35 
 
 		 410 aa  254  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  38.01 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  37.88 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  37.35 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  40.34 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003106  competence/damage-inducible protein CinA  36.68 
 
 		 410 aa  249  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000227791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  35.95 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  37.83 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  38.24 
 
 		 419 aa  243  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  37.59 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  36.04 
 
 		 437 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  37.68 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  36.68 
 
 		 408 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  35.82 
 
 		 415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  37.35 
 
 		 416 aa  239  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  36.52 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.69 
 
 		 429 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  36.56 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  37.47 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  37.73 
 
 		 410 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  36.54 
 
 		 415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  36.68 
 
 		 408 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  36.15 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  35.15 
 
 		 425 aa  233  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  36 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  36.08 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  36.41 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  37.05 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.54 
 
 		 431 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  35.96 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  35.18 
 
 		 413 aa  226  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  34.68 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  34.87 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  37.63 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.93 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  38.5 
 
 		 418 aa  219  6e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  36.52 
 
 		 421 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  36.62 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  33.98 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  34.53 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  35.42 
 
 		 423 aa  215  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  35.01 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  32.56 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  34.32 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.97 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  33.25 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  33.66 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  33.49 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.06 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  32.69 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>