295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3275 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  100 
 
 		 398 aa  805    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  74.06 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  74.06 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  74.06 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  68.01 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  67.51 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  65.49 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  62.72 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  62.03 
 
 		 398 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  62.03 
 
 		 398 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  62.03 
 
 		 398 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  61.77 
 
 		 398 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  61.77 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  61.65 
 
 		 399 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  61.52 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  61.52 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  61.27 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  61.52 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  61.52 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  61.52 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  61.52 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  61.01 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  45.32 
 
 		 415 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003106  competence/damage-inducible protein CinA  42.12 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000227791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  41.28 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  40.15 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  40.34 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  39.33 
 
 		 424 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 424 aa  256  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  38.92 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  39.12 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  38.88 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  38.3 
 
 		 424 aa  253  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  38.63 
 
 		 424 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  38.88 
 
 		 424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  38.29 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  38.29 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  38.39 
 
 		 424 aa  250  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  38.29 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  38.14 
 
 		 424 aa  249  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  39.17 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  39.32 
 
 		 424 aa  243  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  33.41 
 
 		 417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  31.75 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  29.43 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  28.81 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  31.49 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.41 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 412 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  32.92 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  33.71 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  36.04 
 
 		 410 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  34.27 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  37.76 
 
 		 414 aa  152  8.999999999999999e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  30.06 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  30.71 
 
 		 417 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.1 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  28.95 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  33.8 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  32.05 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  31.21 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  29.34 
 
 		 432 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  30.28 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  34.3 
 
 		 391 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  33.11 
 
 		 393 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  32.08 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  34.33 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  33.21 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  29.17 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  35.17 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  32.88 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  30.33 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  32.66 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  32.61 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  32.48 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  27.9 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  28.03 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  25.97 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  31.4 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  29.63 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  26.46 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  29.93 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  27.25 
 
 		 411 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  30.21 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2701  hypothetical protein  32.13 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.94 
 
 		 424 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  28.29 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  30.21 
 
 		 412 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  31.4 
 
 		 416 aa  119  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  30.48 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  30.14 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  43.45 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  31.45 
 
 		 416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  37.37 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  30.34 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  31.79 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2573  hypothetical protein  31.22 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  32.52 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  35.38 
 
 		 425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>