297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2136 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  100 
 
 		 406 aa  786    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  43.87 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  39.95 
 
 		 432 aa  246  6e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  35.7 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  35.7 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  45.03 
 
 		 414 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  35.28 
 
 		 413 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  34.72 
 
 		 411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  46.07 
 
 		 372 aa  232  9e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  34.9 
 
 		 415 aa  229  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  37.16 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  40.44 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  34.18 
 
 		 411 aa  219  8.999999999999998e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  40.88 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  36.89 
 
 		 415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  38.78 
 
 		 416 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  38.29 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  38.78 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  34.91 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  38.4 
 
 		 416 aa  209  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  39.06 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  33.82 
 
 		 412 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  33.58 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  33.57 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  33.58 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  33.58 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  33.58 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  33.66 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  33.58 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  33.58 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  36.1 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  41.27 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  32.35 
 
 		 412 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  32.6 
 
 		 412 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  33.09 
 
 		 412 aa  199  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  31.68 
 
 		 415 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  38.08 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  40.52 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.38 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.56 
 
 		 431 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  32.75 
 
 		 408 aa  192  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  37.56 
 
 		 427 aa  192  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  32.92 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  41.45 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  34.53 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.64 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.88 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  33.58 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  32.71 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  38.42 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  34.35 
 
 		 413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  34.07 
 
 		 413 aa  183  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  31.81 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.27 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  34.54 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  37.85 
 
 		 419 aa  179  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  33.09 
 
 		 408 aa  179  9e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  29.15 
 
 		 406 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  36.03 
 
 		 420 aa  179  9e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  38.11 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  33.01 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  38.15 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  31.86 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1344  competence/damage-inducible protein CinA  35.38 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.827077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1370  competence/damage-inducible protein CinA  35.38 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  31.44 
 
 		 418 aa  169  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  30.98 
 
 		 408 aa  169  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  30.33 
 
 		 401 aa  169  8e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  27.99 
 
 		 415 aa  169  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  32.24 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  32.55 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  31.73 
 
 		 417 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  38.95 
 
 		 423 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 429 aa  166  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  30.75 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1643  competence/damage-inducible protein CinA  30.22 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  33.05 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  29.14 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  32.42 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  34.37 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  35.31 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.96 
 
 		 430 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  33.43 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  31.78 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  33.14 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  35.16 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  33.14 
 
 		 424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  39.5 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  31.14 
 
 		 424 aa  152  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  33.14 
 
 		 424 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  29.95 
 
 		 420 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  31.38 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  31.33 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  32.85 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  32.67 
 
 		 423 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  32.85 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>