More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0062 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  100 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  76.95 
 
 		 271 aa  410  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  78.97 
 
 		 265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  76.68 
 
 		 282 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  65.89 
 
 		 273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  51.98 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  42.46 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  41.83 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  42.27 
 
 		 423 aa  161  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  38.36 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 415 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  40.83 
 
 		 372 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  39.5 
 
 		 406 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3269  molybdopterin binding domain-containing protein  40.54 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  37.14 
 
 		 411 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  39.38 
 
 		 415 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  39.04 
 
 		 413 aa  148  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1991  molybdopterin binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  36.48 
 
 		 419 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0886  molybdopterin binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000053068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  34.8 
 
 		 418 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 		 395 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  37.13 
 
 		 412 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  37.73 
 
 		 414 aa  139  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  35.83 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  32.68 
 
 		 406 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.79 
 
 		 401 aa  138  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  41.06 
 
 		 420 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  37.13 
 
 		 412 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  36.23 
 
 		 412 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  36.73 
 
 		 418 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  34.02 
 
 		 393 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  38.14 
 
 		 417 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  35.27 
 
 		 412 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  35.75 
 
 		 412 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  35.75 
 
 		 412 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  35.75 
 
 		 412 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  35.75 
 
 		 412 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  35.75 
 
 		 412 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  37.07 
 
 		 413 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  34.01 
 
 		 415 aa  135  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  35.75 
 
 		 412 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  39.9 
 
 		 413 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 		 415 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  37.18 
 
 		 420 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  37.98 
 
 		 416 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  35.75 
 
 		 412 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  35.27 
 
 		 412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  35.27 
 
 		 412 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  38.74 
 
 		 427 aa  132  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  32.1 
 
 		 392 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  36.87 
 
 		 411 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  37.44 
 
 		 391 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  34.27 
 
 		 420 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  35.29 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  34.63 
 
 		 415 aa  129  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  43.98 
 
 		 423 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  34.75 
 
 		 413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  37.26 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  37.02 
 
 		 417 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 		 414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  35.12 
 
 		 415 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  40.7 
 
 		 416 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  39.3 
 
 		 412 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  40.91 
 
 		 438 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  45.78 
 
 		 432 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  39.15 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  35.58 
 
 		 414 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  31.52 
 
 		 411 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  35.61 
 
 		 419 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  35.07 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33.94 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  37.2 
 
 		 437 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  35.85 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  36.49 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.91 
 
 		 408 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  36.94 
 
 		 431 aa  123  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  36.36 
 
 		 399 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  35.27 
 
 		 425 aa  122  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  34.75 
 
 		 408 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  35 
 
 		 416 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  40.7 
 
 		 416 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  39.42 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  29.77 
 
 		 424 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  38.46 
 
 		 433 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.61 
 
 		 431 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  39.41 
 
 		 414 aa  121  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  38.35 
 
 		 432 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  36.11 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  33.62 
 
 		 410 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  38.35 
 
 		 425 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  36.74 
 
 		 400 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 423 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  35.42 
 
 		 420 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  31.1 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.87 
 
 		 429 aa  119  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.1 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  38.92 
 
 		 408 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>