295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0886 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0886  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 
274 aa  557  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000053068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  72.63 
 
 
275 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  57.56 
 
 
276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1991  molybdopterin binding domain-containing protein  43.35 
 
 
272 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3269  molybdopterin binding domain-containing protein  41.92 
 
 
274 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  38.21 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  37.05 
 
 
271 aa  150  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  39.34 
 
 
273 aa  149  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  32.67 
 
 
262 aa  145  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  36.87 
 
 
282 aa  140  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  31.54 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  33.46 
 
 
257 aa  125  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  31.84 
 
 
415 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  31.47 
 
 
408 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  35.23 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  35.96 
 
 
392 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  32.56 
 
 
408 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  37.85 
 
 
413 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  30.43 
 
 
415 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  37.02 
 
 
433 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  37.57 
 
 
438 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  31.63 
 
 
408 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  30.3 
 
 
410 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  33.2 
 
 
417 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  31.61 
 
 
391 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  34.29 
 
 
395 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  32.91 
 
 
412 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  32.73 
 
 
401 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  32.76 
 
 
393 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  32.69 
 
 
413 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  34.41 
 
 
420 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  36.73 
 
 
427 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  34.16 
 
 
411 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.88 
 
 
433 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  32.48 
 
 
412 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  28.96 
 
 
406 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  31.91 
 
 
423 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  34.68 
 
 
437 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  33.71 
 
 
411 aa  102  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  36.46 
 
 
432 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  25.94 
 
 
415 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  33.33 
 
 
424 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.95 
 
 
431 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  36.61 
 
 
414 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  29.44 
 
 
424 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  34.29 
 
 
416 aa  96.3  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.16 
 
 
424 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  34.92 
 
 
419 aa  96.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  31.31 
 
 
425 aa  96.3  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  30.52 
 
 
415 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33.68 
 
 
408 aa  95.9  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
416 aa  95.9  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.16 
 
 
424 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  34.81 
 
 
372 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  34.33 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  30.8 
 
 
416 aa  94.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.22 
 
 
401 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  28.1 
 
 
417 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  32.16 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.94 
 
 
430 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  29.51 
 
 
255 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  31.82 
 
 
416 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1922  molybdopterin binding domain protein  35.96 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  35.52 
 
 
414 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.11 
 
 
429 aa  92  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  27.2 
 
 
415 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  32.58 
 
 
430 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  31.18 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  31.73 
 
 
418 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  29.39 
 
 
415 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  33.7 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  30.41 
 
 
424 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
400 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  36.07 
 
 
400 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
400 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
400 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
400 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
400 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  36.07 
 
 
400 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
400 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  34.97 
 
 
414 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  34.05 
 
 
421 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  31.19 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  34.05 
 
 
421 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  34.05 
 
 
421 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  28.07 
 
 
382 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  30.64 
 
 
419 aa  89.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  27.99 
 
 
254 aa  89.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  35.39 
 
 
422 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
398 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
398 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
398 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
398 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
398 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  28.36 
 
 
412 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  34.55 
 
 
413 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  31.43 
 
 
417 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  31.11 
 
 
413 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  30.9 
 
 
411 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  27.36 
 
 
412 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>