More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0347 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  84.44 
 
 		 391 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 393 aa  784    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  66.24 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  48.85 
 
 		 392 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  41.83 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  33.58 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  39.94 
 
 		 420 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  36.66 
 
 		 411 aa  219  8.999999999999998e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  40.34 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  35.4 
 
 		 419 aa  216  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  33.25 
 
 		 416 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.44 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.61 
 
 		 424 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  32.69 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  37.8 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  34.36 
 
 		 424 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  32.45 
 
 		 416 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  37.46 
 
 		 412 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  37.83 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.18 
 
 		 429 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  30.84 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  34.66 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  35.41 
 
 		 412 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  35.41 
 
 		 412 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  37.24 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  34.84 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  35.13 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  35.13 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  35.13 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  35.13 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.43 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  35.13 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  35.13 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  35.13 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.43 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  37.42 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  36.08 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  40.21 
 
 		 415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  33.09 
 
 		 418 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  38.87 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  36.65 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  30 
 
 		 415 aa  196  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  33.25 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  35.92 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  33.43 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  44.26 
 
 		 406 aa  193  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  34.97 
 
 		 432 aa  192  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  39.93 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  36.33 
 
 		 413 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  31.2 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  32.34 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  40.83 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  40.89 
 
 		 433 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.1 
 
 		 430 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  29.95 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  29.58 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  39.39 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  37.23 
 
 		 413 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  39.94 
 
 		 427 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1344  competence/damage-inducible protein CinA  33.44 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.827077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1370  competence/damage-inducible protein CinA  33.44 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  39.87 
 
 		 438 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  28.49 
 
 		 406 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  37.46 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  32.79 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  34.7 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1643  competence/damage-inducible protein CinA  35.47 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  30.99 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  30.02 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  32.12 
 
 		 415 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  28.92 
 
 		 424 aa  159  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  31.22 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  32.49 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  29.16 
 
 		 424 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  29.16 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  32.49 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  44.62 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  32.49 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  29.16 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  29.06 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  29.16 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  33.44 
 
 		 423 aa  156  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.35 
 
 		 401 aa  156  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  32.24 
 
 		 398 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  29.37 
 
 		 410 aa  156  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  28.81 
 
 		 425 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  28.81 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  28.54 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  31.99 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  31.74 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  30.68 
 
 		 414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  28.81 
 
 		 424 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  32.37 
 
 		 413 aa  152  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  33.76 
 
 		 423 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  28.78 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  36.57 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  34.54 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  43.55 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  38.63 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  33.66 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>