296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2121 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  100 
 
 		 272 aa  545  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  52.92 
 
 		 264 aa  278  6e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  43.87 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  42.46 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  42.58 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  45.85 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  45.7 
 
 		 273 aa  206  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  44.49 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.5 
 
 		 401 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1991  molybdopterin binding domain-containing protein  32.85 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  33.46 
 
 		 399 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  34.63 
 
 		 415 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  33.46 
 
 		 411 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3269  molybdopterin binding domain-containing protein  31.11 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  33.7 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 		 393 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 		 413 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  36.21 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  40.74 
 
 		 410 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  29.46 
 
 		 411 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  35 
 
 		 414 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  29.55 
 
 		 392 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  40.83 
 
 		 408 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  38.51 
 
 		 395 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  31.75 
 
 		 372 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  30.35 
 
 		 413 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  35.68 
 
 		 423 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  40.83 
 
 		 408 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  34.56 
 
 		 275 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  40.83 
 
 		 408 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.25 
 
 		 431 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  34.7 
 
 		 415 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.45 
 
 		 424 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  37.65 
 
 		 391 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  33.09 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  33.58 
 
 		 420 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  35.32 
 
 		 424 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  32.75 
 
 		 410 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  35.71 
 
 		 418 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.65 
 
 		 424 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  33.33 
 
 		 418 aa  115  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  30.8 
 
 		 411 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  34.33 
 
 		 414 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  36.72 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  32.38 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  32.5 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  32.5 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  32.82 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  32.5 
 
 		 425 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0886  molybdopterin binding domain-containing protein  35.23 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000053068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  31.47 
 
 		 424 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  32.18 
 
 		 415 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  35.29 
 
 		 412 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  32.19 
 
 		 424 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 		 432 aa  112  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 		 412 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 		 412 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 		 412 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  34.8 
 
 		 420 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  33.46 
 
 		 430 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 		 412 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 		 412 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 		 412 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  32.2 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  33.99 
 
 		 412 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  36.45 
 
 		 414 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  30 
 
 		 406 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  27.31 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  32.52 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  33.5 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  39.87 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  33.88 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  36.59 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  32.79 
 
 		 432 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  35.03 
 
 		 425 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.62 
 
 		 433 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1711  molybdopterin binding domain protein  41.57 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  35.76 
 
 		 416 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  33.73 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  33.82 
 
 		 423 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  28.8 
 
 		 424 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.62 
 
 		 430 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  31.76 
 
 		 424 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2333  molybdopterin binding domain protein  41.14 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.651571 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 		 415 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  38.04 
 
 		 420 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  31.82 
 
 		 424 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  35.38 
 
 		 423 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  29.39 
 
 		 400 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 		 412 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  33.02 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  33.47 
 
 		 424 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  28.78 
 
 		 408 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  29.39 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  36.69 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  33.88 
 
 		 424 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  36.44 
 
 		 423 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  33.91 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>