More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1092 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 		 401 aa  808    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  33.01 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  31.96 
 
 		 424 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 		 424 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  33.66 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  31.97 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  31.23 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  35.6 
 
 		 420 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  32.77 
 
 		 424 aa  176  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  35.56 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  31.14 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  31.14 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  37.46 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  31.14 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  30.9 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  31.19 
 
 		 415 aa  169  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  35.65 
 
 		 416 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  30.48 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  35.49 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  30.9 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  33.08 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  33.08 
 
 		 398 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  31.78 
 
 		 424 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  33.08 
 
 		 398 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  33.08 
 
 		 398 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  33.08 
 
 		 398 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  33.91 
 
 		 400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  30.1 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003106  competence/damage-inducible protein CinA  30.45 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000227791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  33.91 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  33.91 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  33.91 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  30.34 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  33.91 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  34.25 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  33.91 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  33.66 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  32.5 
 
 		 411 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  34.75 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  30.35 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  32.76 
 
 		 414 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  30.9 
 
 		 420 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  32.18 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  33.83 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  44.56 
 
 		 414 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  40.89 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  31.51 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  42.35 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  39.52 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  32.37 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  40.89 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  42.35 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  43.15 
 
 		 416 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  31.56 
 
 		 417 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  33.91 
 
 		 397 aa  156  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  30.68 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  40.44 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  40.44 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  28.78 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  29.23 
 
 		 419 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  32.4 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  31.97 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  27.68 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  31.62 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  31.61 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  34.96 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  42.04 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  33.97 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  34.09 
 
 		 420 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  35.2 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  35.74 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  46.88 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  30.79 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  32.29 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  32.87 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  35.5 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  37.86 
 
 		 397 aa  142  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 412 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 412 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  31.86 
 
 		 432 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 412 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  32.99 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  33.73 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.89 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  29.07 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  41.88 
 
 		 273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  33.54 
 
 		 423 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  37.95 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  34.69 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  29.22 
 
 		 416 aa  140  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  36.89 
 
 		 408 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  37.44 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  30.34 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>