More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13568 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  100 
 
 
415 aa  847    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  55.66 
 
 
417 aa  495  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  44.9 
 
 
423 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  45.91 
 
 
415 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  43.69 
 
 
417 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  43 
 
 
418 aa  362  9e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  44.04 
 
 
418 aa  352  8.999999999999999e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 
413 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  36.43 
 
 
420 aa  282  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  37.74 
 
 
412 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  35.68 
 
 
411 aa  269  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  37.5 
 
 
412 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  36.46 
 
 
423 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  36.12 
 
 
416 aa  266  4e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  37.59 
 
 
429 aa  266  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  36.82 
 
 
416 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  36.28 
 
 
416 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  35.93 
 
 
416 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  37.06 
 
 
417 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  34.37 
 
 
418 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  36.17 
 
 
416 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  33.89 
 
 
415 aa  261  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  39.28 
 
 
418 aa  253  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  36.89 
 
 
413 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  35.78 
 
 
425 aa  250  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  34.35 
 
 
433 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  36.75 
 
 
412 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.44 
 
 
433 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  35.66 
 
 
414 aa  246  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  36.15 
 
 
432 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.56 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  33.73 
 
 
413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  34.37 
 
 
413 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  36.41 
 
 
412 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  36.85 
 
 
412 aa  242  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  36.46 
 
 
430 aa  242  7e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  33.02 
 
 
421 aa  242  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  34.67 
 
 
411 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  36.41 
 
 
412 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  34.83 
 
 
415 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  35.29 
 
 
416 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  33.9 
 
 
432 aa  240  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  36.26 
 
 
412 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.31 
 
 
431 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  36.26 
 
 
412 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  35.55 
 
 
412 aa  239  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  35.78 
 
 
412 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  35.7 
 
 
412 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  33.89 
 
 
419 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  34.31 
 
 
427 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.34 
 
 
430 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  36.26 
 
 
412 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.12 
 
 
424 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  36.26 
 
 
412 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  34.77 
 
 
411 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  32.93 
 
 
419 aa  236  6e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  33.42 
 
 
414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  36.1 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  35.87 
 
 
413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  34.91 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  35.85 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  32.85 
 
 
414 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  31.4 
 
 
415 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  33.41 
 
 
413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  34.3 
 
 
420 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  32.69 
 
 
412 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  34.9 
 
 
423 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  32.94 
 
 
420 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  31.49 
 
 
420 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  34.73 
 
 
423 aa  230  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  33.01 
 
 
413 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  36.03 
 
 
431 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  35.51 
 
 
420 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  31.65 
 
 
437 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  33.25 
 
 
425 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  33.25 
 
 
425 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  32.99 
 
 
425 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  33.51 
 
 
424 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
438 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  34.92 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  32.62 
 
 
425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.12 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  34.11 
 
 
424 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  33.51 
 
 
424 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  33.25 
 
 
424 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  33.25 
 
 
424 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  29.81 
 
 
443 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  32.99 
 
 
424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  32.06 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.16 
 
 
429 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  32.73 
 
 
424 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  29.95 
 
 
408 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  32.17 
 
 
419 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  33.51 
 
 
424 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  32.7 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  32.07 
 
 
417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  32.63 
 
 
424 aa  213  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  29.7 
 
 
408 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  33.25 
 
 
424 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  31.73 
 
 
424 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.045921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>