More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0186 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  79.95 
 
 		 424 aa  705    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  79.01 
 
 		 424 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  78.54 
 
 		 424 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  78.77 
 
 		 424 aa  697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  72.88 
 
 		 424 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  74.29 
 
 		 424 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  76.42 
 
 		 424 aa  676    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  78.54 
 
 		 424 aa  697    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  79.72 
 
 		 425 aa  703    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  79.72 
 
 		 425 aa  701    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 424 aa  877    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  78.77 
 
 		 424 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  79.72 
 
 		 425 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  73.58 
 
 		 424 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  75 
 
 		 424 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  70.28 
 
 		 424 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  42.51 
 
 		 397 aa  286  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  39.29 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  41.9 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  41.32 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  38.22 
 
 		 420 aa  276  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  49.47 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  49.47 
 
 		 400 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  49.47 
 
 		 400 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  49.47 
 
 		 400 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  49.47 
 
 		 400 aa  274  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  49.12 
 
 		 400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  42.05 
 
 		 397 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  49.12 
 
 		 400 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  40.91 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  38.59 
 
 		 413 aa  272  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  40.91 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  40.91 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  40.67 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  36.92 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  40.67 
 
 		 398 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  40.48 
 
 		 413 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  38.5 
 
 		 413 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  49.12 
 
 		 397 aa  265  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  37.84 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  49.12 
 
 		 397 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  38.05 
 
 		 414 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  35.39 
 
 		 423 aa  256  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  37.56 
 
 		 414 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  35.19 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  36.59 
 
 		 413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  36.3 
 
 		 417 aa  252  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  39.12 
 
 		 397 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  39.12 
 
 		 397 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  39.12 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  36.9 
 
 		 411 aa  249  6e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  35.51 
 
 		 437 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  36.49 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  35.93 
 
 		 410 aa  243  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003106  competence/damage-inducible protein CinA  37.08 
 
 		 410 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000227791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  36.84 
 
 		 424 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  34.95 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  34.48 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  31.88 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  36.14 
 
 		 416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  36.78 
 
 		 416 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  34.71 
 
 		 412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  33.95 
 
 		 408 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  36.14 
 
 		 415 aa  232  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  35.58 
 
 		 432 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  35.9 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  34.93 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  33.91 
 
 		 420 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  35.21 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  37.77 
 
 		 416 aa  230  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  33.95 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  34.09 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  32.85 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  35.84 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  34.38 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  32.85 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  33.17 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  35.04 
 
 		 425 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  34.94 
 
 		 413 aa  222  9e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  34.54 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  35.11 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  33.5 
 
 		 415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  33.65 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  32.77 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  33.73 
 
 		 423 aa  219  7e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  34.7 
 
 		 414 aa  219  7.999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  34.14 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  32.63 
 
 		 415 aa  213  7e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  34.29 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  34.91 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.9 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  34.28 
 
 		 421 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  34.28 
 
 		 421 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  32.68 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  34.28 
 
 		 421 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  33.89 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  32.17 
 
 		 432 aa  206  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  32.68 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  33.92 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>