298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1051 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  78.84 
 
 
397 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  100 
 
 
397 aa  810    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  79.09 
 
 
397 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  77.58 
 
 
397 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  65.99 
 
 
397 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  65.99 
 
 
397 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  65.49 
 
 
397 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  65.49 
 
 
398 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  63.48 
 
 
398 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  63.48 
 
 
398 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  63.48 
 
 
398 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.960732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  63.25 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  63.25 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  63.25 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  62.97 
 
 
398 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  63 
 
 
400 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  63 
 
 
400 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  63.22 
 
 
398 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  63 
 
 
400 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  63.25 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  63 
 
 
400 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  63.16 
 
 
399 aa  491  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  42.93 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  41.56 
 
 
424 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  40.57 
 
 
424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  41 
 
 
410 aa  282  7.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  41.79 
 
 
424 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  41.65 
 
 
424 aa  279  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  40.59 
 
 
424 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  40.46 
 
 
424 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  40.34 
 
 
424 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  40.1 
 
 
424 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  40.34 
 
 
424 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  39.42 
 
 
424 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  41.45 
 
 
424 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003106  competence/damage-inducible protein CinA  39.31 
 
 
410 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000227791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  39.32 
 
 
424 aa  266  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  40.05 
 
 
424 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  39.12 
 
 
424 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  39.71 
 
 
425 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  39.71 
 
 
425 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  39.71 
 
 
425 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  34.62 
 
 
413 aa  193  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  31.43 
 
 
432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  34.38 
 
 
413 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  30.9 
 
 
420 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  37.46 
 
 
412 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  36.99 
 
 
417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  34.75 
 
 
408 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  37.89 
 
 
414 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 
414 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  32.29 
 
 
413 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  35.82 
 
 
410 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  34.04 
 
 
408 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.92 
 
 
408 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  32.4 
 
 
413 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.86 
 
 
401 aa  149  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  30.43 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  34.71 
 
 
416 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  35.74 
 
 
414 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  34.59 
 
 
416 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  31.72 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  28.71 
 
 
423 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  34.03 
 
 
393 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  33.8 
 
 
420 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  34.55 
 
 
391 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  32.72 
 
 
395 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  30.12 
 
 
418 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  32.53 
 
 
411 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  32.75 
 
 
424 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  31.25 
 
 
418 aa  133  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  30.79 
 
 
425 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  33.84 
 
 
416 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.16 
 
 
429 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  28.44 
 
 
406 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  28.84 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  34.15 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  35.46 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  33.53 
 
 
416 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  30.56 
 
 
419 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  34.25 
 
 
414 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  35.17 
 
 
432 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  32.99 
 
 
412 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  28.97 
 
 
415 aa  126  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.41 
 
 
424 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  26.86 
 
 
415 aa  126  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  31.53 
 
 
372 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  32.54 
 
 
412 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.33 
 
 
431 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.32 
 
 
424 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  32.2 
 
 
412 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  32.2 
 
 
412 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  31.03 
 
 
411 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  32.46 
 
 
423 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  33.78 
 
 
420 aa  122  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  32.2 
 
 
412 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  32.2 
 
 
412 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  32.31 
 
 
412 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  32.2 
 
 
412 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>