More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0198 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  72.88 
 
 		 424 aa  634    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  73.35 
 
 		 424 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  73.58 
 
 		 424 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  73.35 
 
 		 424 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  72.41 
 
 		 424 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 424 aa  872    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  73.35 
 
 		 424 aa  641    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  72.64 
 
 		 425 aa  634    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  72.88 
 
 		 424 aa  633  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  72.64 
 
 		 425 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  71.46 
 
 		 424 aa  630  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  72.17 
 
 		 425 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  71.93 
 
 		 424 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  70.28 
 
 		 424 aa  621  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  70.28 
 
 		 424 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  69.34 
 
 		 424 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  40.71 
 
 		 417 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  37.32 
 
 		 423 aa  269  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  37.98 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  39.09 
 
 		 413 aa  259  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  41.45 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  38.93 
 
 		 413 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  37.97 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  39.14 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  37.53 
 
 		 415 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  39.38 
 
 		 398 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  39.62 
 
 		 399 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  34.76 
 
 		 432 aa  252  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  40.24 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  40.24 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  39.38 
 
 		 398 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  39.38 
 
 		 398 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  38.98 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  36.88 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  39.71 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  36.56 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  40 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  39.76 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  39.76 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  35.9 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  39.52 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  39.23 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  37.98 
 
 		 415 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  36.88 
 
 		 424 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  37.35 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003106  competence/damage-inducible protein CinA  37.47 
 
 		 410 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000227791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  36.76 
 
 		 414 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  37.2 
 
 		 397 aa  235  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  37.2 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  37.01 
 
 		 414 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  36.63 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  37.2 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  36.17 
 
 		 408 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  36.47 
 
 		 413 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  37.11 
 
 		 416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  35.63 
 
 		 412 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  36.87 
 
 		 416 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  36.94 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  36.6 
 
 		 416 aa  229  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  35.37 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  39.32 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  35.79 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  36.59 
 
 		 416 aa  227  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  35.95 
 
 		 412 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  36.39 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  37.74 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  35.71 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  35.9 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  34.88 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  33.9 
 
 		 415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  35.99 
 
 		 418 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  36.76 
 
 		 419 aa  219  7e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  33.91 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  34.94 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  32.93 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  34.44 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  35.61 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.99 
 
 		 429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  36.39 
 
 		 421 aa  212  9e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  35.11 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  34.62 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  39.32 
 
 		 414 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  33.88 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  31.73 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  34.36 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  34.73 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  34.76 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  34.22 
 
 		 432 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  32.84 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  36.34 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  35.11 
 
 		 432 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  36.17 
 
 		 420 aa  202  8e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  33.74 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  36.15 
 
 		 438 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  32.21 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.94 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>