280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003106 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003106  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 410 aa  847    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000227791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  84.63 
 
 		 424 aa  733    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  60.24 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  52.2 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  41.08 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 400 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  39.8 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  39.8 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  39.8 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  39.76 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  39.76 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  39.76 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  39.76 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  39.76 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  39.51 
 
 		 400 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  39.56 
 
 		 398 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  39.76 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  39.56 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  40.29 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  39.22 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  41.48 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  38.72 
 
 		 425 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  38.72 
 
 		 425 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  39.9 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  42.12 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  38.72 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  39.9 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  39.9 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  38.82 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  38.52 
 
 		 424 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  39.31 
 
 		 397 aa  259  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  37 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  38.59 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  38.28 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  38.28 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  38.04 
 
 		 424 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  36.68 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  37.08 
 
 		 424 aa  249  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  36.53 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  36.52 
 
 		 424 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  37.47 
 
 		 424 aa  242  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  35.96 
 
 		 424 aa  242  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  30.73 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  32.69 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.45 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  29.58 
 
 		 417 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  32.22 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  29.93 
 
 		 420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  30.38 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  30.9 
 
 		 414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  32.22 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  30.88 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  27.4 
 
 		 411 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  27.59 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  29.88 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  31.66 
 
 		 411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  29.7 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  29.47 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  29.95 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  28.4 
 
 		 419 aa  133  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  27.78 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  27.08 
 
 		 417 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  27.07 
 
 		 413 aa  132  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  29.86 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  27.98 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  30.09 
 
 		 406 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  29.45 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  26.26 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  33.8 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  26.62 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  25.12 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2573  hypothetical protein  28.03 
 
 		 365 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  38.78 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2701  hypothetical protein  28.03 
 
 		 365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  25 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  27.58 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  27.25 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  29.81 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  25.06 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  26.78 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  28.03 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  27.4 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  31.27 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  26.93 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  26.9 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  33.04 
 
 		 273 aa  114  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  27.4 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  30.65 
 
 		 265 aa  113  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  34.52 
 
 		 262 aa  112  9e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  28.15 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  26.7 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  29 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  29.63 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  26.11 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  28.07 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  26.6 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  37.27 
 
 		 272 aa  109  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  27.8 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  25.97 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  30.13 
 
 		 282 aa  109  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>