291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2701 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2701  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  754    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2573  hypothetical protein  98.36 
 
 
365 aa  743    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  31.91 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  32.77 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  31.49 
 
 
413 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  30.47 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  29.18 
 
 
399 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  29.63 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  29.64 
 
 
397 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  31.29 
 
 
411 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  29.27 
 
 
413 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  29.86 
 
 
400 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  29.86 
 
 
400 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  29.86 
 
 
400 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  29.86 
 
 
400 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  29.86 
 
 
400 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  29.86 
 
 
400 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  29.51 
 
 
400 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  28.18 
 
 
412 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  33.79 
 
 
413 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  30.15 
 
 
425 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  29.51 
 
 
400 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  28.42 
 
 
413 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  28.18 
 
 
412 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  30.39 
 
 
414 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  29.41 
 
 
417 aa  123  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  28.75 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  28.91 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  28.82 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  28.82 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  25.09 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  28.82 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  28.82 
 
 
398 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  28.82 
 
 
398 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  25.48 
 
 
424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  26.39 
 
 
424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  32.67 
 
 
412 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  26.39 
 
 
424 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  32.67 
 
 
412 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  32.67 
 
 
412 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  33.17 
 
 
412 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  32.67 
 
 
412 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  26.04 
 
 
424 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  32.67 
 
 
412 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  32.67 
 
 
412 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  34.02 
 
 
412 aa  119  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  32.67 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  27.86 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  29.08 
 
 
414 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  25.7 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  27.15 
 
 
415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  26.65 
 
 
424 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  26.04 
 
 
425 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  26.04 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  28.72 
 
 
424 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  31.68 
 
 
412 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003106  competence/damage-inducible protein CinA  28.03 
 
 
410 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000227791  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  26.04 
 
 
425 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  32.67 
 
 
412 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  27.97 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  30.31 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  32.89 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  25.69 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  25.69 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  28.67 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  31.54 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  33.82 
 
 
408 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  26.22 
 
 
424 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  32.16 
 
 
423 aa  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  30.41 
 
 
418 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  31.47 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  29.53 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  31.47 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  29.86 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1344  competence/damage-inducible protein CinA  28.17 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.827077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1370  competence/damage-inducible protein CinA  28.17 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  31.47 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  30.45 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  32.67 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  32.74 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  28.04 
 
 
415 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  25.35 
 
 
424 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  35 
 
 
265 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  28.42 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  25.55 
 
 
425 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  28.17 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  25.43 
 
 
416 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  32.84 
 
 
415 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  28.24 
 
 
395 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 
421 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  28.12 
 
 
432 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  27.27 
 
 
418 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  27.08 
 
 
406 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  32.13 
 
 
398 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  27.76 
 
 
417 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1643  competence/damage-inducible protein CinA  31.48 
 
 
393 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  29.91 
 
 
393 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.86 
 
 
429 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  28.22 
 
 
416 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  25.09 
 
 
416 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>