More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2329 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 
408 aa  810    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  44.53 
 
 
411 aa  327  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  44.5 
 
 
413 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  42.4 
 
 
411 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  41.71 
 
 
412 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  39.4 
 
 
412 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  41.46 
 
 
412 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  41.46 
 
 
412 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  39.4 
 
 
412 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  41.71 
 
 
412 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  41.46 
 
 
412 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  41.46 
 
 
412 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  41.46 
 
 
412 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  40.98 
 
 
412 aa  292  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  41.22 
 
 
412 aa  292  9e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  41.22 
 
 
412 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  38.67 
 
 
416 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  40.98 
 
 
412 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  38.67 
 
 
416 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  38.46 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  38.33 
 
 
416 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  38.1 
 
 
414 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  39.27 
 
 
413 aa  275  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  41.65 
 
 
413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  37.33 
 
 
417 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  34.64 
 
 
418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  39.8 
 
 
416 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  36.48 
 
 
415 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  37.59 
 
 
425 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  36.07 
 
 
413 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  37.28 
 
 
415 aa  263  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  37.56 
 
 
432 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  37.88 
 
 
415 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  38.79 
 
 
423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  36.03 
 
 
421 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  36.57 
 
 
411 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.87 
 
 
433 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.92 
 
 
424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  36.76 
 
 
415 aa  253  6e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  36.1 
 
 
414 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.32 
 
 
430 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.64 
 
 
431 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  34.39 
 
 
420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  36.56 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  38.81 
 
 
401 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37 
 
 
424 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  33.33 
 
 
430 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.2 
 
 
429 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  35.29 
 
 
420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  35.92 
 
 
424 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  35.32 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  35.98 
 
 
427 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  33.17 
 
 
419 aa  227  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  36.86 
 
 
425 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  35.05 
 
 
408 aa  219  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  33.17 
 
 
419 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  35.05 
 
 
408 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  33 
 
 
420 aa  216  9e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  34.55 
 
 
433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  33.17 
 
 
419 aa  212  7e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  34.06 
 
 
438 aa  210  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  32.46 
 
 
429 aa  209  8e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  34.64 
 
 
401 aa  209  9e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  30.98 
 
 
420 aa  209  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  31.59 
 
 
412 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  30.77 
 
 
415 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  33.17 
 
 
423 aa  206  6e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33 
 
 
408 aa  206  8e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  32.45 
 
 
418 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  31.5 
 
 
420 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  31.26 
 
 
423 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 
423 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  32.35 
 
 
418 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  30.23 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  29.6 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  33.25 
 
 
432 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  31.67 
 
 
443 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  33 
 
 
413 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  31.17 
 
 
414 aa  195  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  35.92 
 
 
393 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  37.55 
 
 
391 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  31.81 
 
 
372 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  32.33 
 
 
413 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  30.86 
 
 
403 aa  190  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  30.62 
 
 
430 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  29.5 
 
 
437 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  30.07 
 
 
414 aa  187  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  36.33 
 
 
395 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  31.31 
 
 
418 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  30.53 
 
 
414 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  29.63 
 
 
424 aa  182  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  28.08 
 
 
414 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  29.63 
 
 
424 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  32.24 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  32.74 
 
 
416 aa  179  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  33.25 
 
 
399 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  31.38 
 
 
413 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  28 
 
 
408 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  28.68 
 
 
424 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1643  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 
393 aa  177  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0787284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>