More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0223 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  77.83 
 
 		 424 aa  688    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  79.01 
 
 		 424 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  75.94 
 
 		 424 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  78.54 
 
 		 424 aa  693    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  78.77 
 
 		 424 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  72.41 
 
 		 424 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  77.83 
 
 		 424 aa  692    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 424 aa  866    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  77.59 
 
 		 425 aa  688    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  78.07 
 
 		 425 aa  692    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  74.29 
 
 		 424 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  74.06 
 
 		 424 aa  660    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  78.07 
 
 		 425 aa  692    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  77.36 
 
 		 424 aa  673    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  78.77 
 
 		 424 aa  695    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  70.99 
 
 		 424 aa  628  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  41.23 
 
 		 399 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  40.14 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  40.14 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  40.14 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  40.14 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  40.62 
 
 		 400 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  39.9 
 
 		 400 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  40.19 
 
 		 417 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  39.9 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  40.52 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  39.67 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  40.14 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  39.67 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  39.67 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  39.9 
 
 		 398 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  39.43 
 
 		 398 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  40.33 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  38.24 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  38.11 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  39.9 
 
 		 413 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  39.76 
 
 		 413 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  37.71 
 
 		 432 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  38.76 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  37.74 
 
 		 397 aa  259  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  36.14 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  38.21 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  38.14 
 
 		 414 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  36.86 
 
 		 412 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  37.32 
 
 		 420 aa  256  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  37.74 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  38.29 
 
 		 414 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  37.18 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  37.38 
 
 		 413 aa  249  9e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  37.25 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  35.95 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  36.26 
 
 		 397 aa  247  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  36.75 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  36.26 
 
 		 397 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  36.26 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  36 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003106  competence/damage-inducible protein CinA  36.53 
 
 		 410 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000227791  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  35.49 
 
 		 415 aa  242  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  37.75 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  34.95 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 		 410 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  37.35 
 
 		 416 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  38.3 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  36.82 
 
 		 414 aa  236  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  35.63 
 
 		 420 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  37.19 
 
 		 416 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.62 
 
 		 429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  35.9 
 
 		 416 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  35.82 
 
 		 432 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  34.01 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  35.9 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  34.55 
 
 		 415 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  36.47 
 
 		 419 aa  229  7e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  34.71 
 
 		 413 aa  229  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  34.77 
 
 		 408 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  35.84 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  35.82 
 
 		 415 aa  225  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.59 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  34.48 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  35.59 
 
 		 412 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  36.54 
 
 		 418 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  35.02 
 
 		 417 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  34.38 
 
 		 415 aa  220  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  35.24 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  33.51 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  33.93 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  38.04 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  31.82 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  33.25 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  32.61 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  37.47 
 
 		 414 aa  212  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  34.14 
 
 		 432 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  32.3 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  36.48 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  34.83 
 
 		 425 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  34.99 
 
 		 430 aa  209  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  33.81 
 
 		 411 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  34.3 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  35.05 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>