293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0871 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  100 
 
 		 415 aa  862    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  59.47 
 
 		 424 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003106  competence/damage-inducible protein CinA  60.24 
 
 		 410 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000227791  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  49.15 
 
 		 410 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  43.6 
 
 		 397 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  43.6 
 
 		 397 aa  319  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  43.83 
 
 		 397 aa  310  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  42.61 
 
 		 398 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  42.61 
 
 		 398 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  42.61 
 
 		 398 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  42.61 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  42.68 
 
 		 397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  43.14 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  43.14 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  43.14 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  43.14 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  43.14 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  42.36 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  43.14 
 
 		 400 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  42.89 
 
 		 400 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  44.02 
 
 		 399 aa  302  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  43.26 
 
 		 397 aa  302  8.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  43.26 
 
 		 397 aa  302  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  43.26 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  42.65 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  45.32 
 
 		 398 aa  298  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  37.09 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  37.09 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  38.3 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  37.09 
 
 		 425 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  36.71 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  37.18 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  37.18 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  37.96 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  36.94 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  38.35 
 
 		 424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  38.12 
 
 		 424 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  38.14 
 
 		 424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.46 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  36.99 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  31.23 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  32.45 
 
 		 412 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  38.1 
 
 		 413 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  36.36 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  33.1 
 
 		 414 aa  160  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  36.79 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  34.69 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  29.75 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  30.55 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  33 
 
 		 419 aa  146  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  29.27 
 
 		 416 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  31.01 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  29.11 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  28.99 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  33.92 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  32.49 
 
 		 423 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  30.22 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  32.53 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  32.01 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  30.74 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  28.57 
 
 		 415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  33.11 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  28.19 
 
 		 421 aa  136  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  31.76 
 
 		 410 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  27.27 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  34.04 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2573  hypothetical protein  29.63 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2701  hypothetical protein  29.63 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  31.7 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  28.61 
 
 		 406 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  30.45 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  27.46 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  28.24 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  28.57 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  29.29 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  24.57 
 
 		 420 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  29.19 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  26.58 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  33.99 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  29.02 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  30.77 
 
 		 416 aa  126  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  29.61 
 
 		 432 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  28.05 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  27.7 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  26.89 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  28.81 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  27.7 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  27.36 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  29.49 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  27.6 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.61 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  35.75 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  30.69 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  26.86 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.79 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  26.72 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>