More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2478 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  83.33 
 
 		 399 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  88.66 
 
 		 400 aa  733    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  88.66 
 
 		 400 aa  733    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  88.66 
 
 		 400 aa  733    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  99.5 
 
 		 398 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  88.66 
 
 		 400 aa  731    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  88.41 
 
 		 400 aa  731    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  88.41 
 
 		 400 aa  728    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  99.75 
 
 		 398 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  99.75 
 
 		 398 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  100 
 
 		 398 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  88.66 
 
 		 400 aa  733    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  88.41 
 
 		 400 aa  733    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  99.5 
 
 		 398 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  63.25 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  63.22 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  64.23 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  60.2 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  60.2 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  62.72 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  59.95 
 
 		 397 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  61.77 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  42.61 
 
 		 415 aa  295  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  40.86 
 
 		 424 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  41.15 
 
 		 424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  41.63 
 
 		 424 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  40.14 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  40.05 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  39.34 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  40.43 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  40.62 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  40.38 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  39.34 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  39.34 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  40.62 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003106  competence/damage-inducible protein CinA  39.56 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000227791  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  40.38 
 
 		 424 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  39.19 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  40.91 
 
 		 424 aa  272  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  39.43 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  38.48 
 
 		 424 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  39.38 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  33.9 
 
 		 413 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  33.82 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  31.95 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  39.79 
 
 		 410 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  36.55 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  33.98 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  29.78 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  38.46 
 
 		 414 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.08 
 
 		 401 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  34.24 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  35.07 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  36.71 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  34.81 
 
 		 408 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  32.74 
 
 		 391 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  34.6 
 
 		 408 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  32.52 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  30.94 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  30.05 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  32.24 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  31.23 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  30.61 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  25.72 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  31.31 
 
 		 418 aa  143  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  28.95 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  28.95 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  35.22 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  29.98 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  31.62 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  32.39 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  31.49 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  32.87 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  34.95 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.27 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.66 
 
 		 433 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  29.67 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  28.61 
 
 		 432 aa  129  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  30.69 
 
 		 416 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  32.53 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  29.38 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  34.71 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  35.27 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  33.92 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.14 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.41 
 
 		 424 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  32.73 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  29.86 
 
 		 425 aa  126  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  32.54 
 
 		 416 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  27.87 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  31.62 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  31.62 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  26.21 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  28.67 
 
 		 415 aa  122  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  28.5 
 
 		 437 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  29.34 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  32.99 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2424  hypothetical protein  98.25 
 
 		 58 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  32.88 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  27.72 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>