More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0196 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 413 aa  811    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  72.09 
 
 		 413 aa  541  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  59.22 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  54.85 
 
 		 414 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  53.14 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  50.24 
 
 		 412 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  49.88 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  42.27 
 
 		 419 aa  296  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  39.71 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 		 425 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  39.71 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  39.71 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  38.98 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  43.9 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  40.92 
 
 		 424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  39.71 
 
 		 424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  40.92 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  38.5 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  37.05 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  35.77 
 
 		 415 aa  275  8e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  40.82 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  39.32 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  39.76 
 
 		 424 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  37.62 
 
 		 413 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  39.08 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  35.92 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  37.05 
 
 		 412 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  37.05 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  38.93 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.01 
 
 		 413 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  41.75 
 
 		 408 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  38.37 
 
 		 411 aa  263  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  36.3 
 
 		 415 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  35.89 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  41.41 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  38.41 
 
 		 437 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  41.1 
 
 		 410 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  40.91 
 
 		 408 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  37.83 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  33.65 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  36.92 
 
 		 432 aa  252  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  37.71 
 
 		 418 aa  252  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  40.91 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  33.73 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  37.05 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  38.74 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  36.98 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  34.31 
 
 		 418 aa  242  7.999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  38.59 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 		 416 aa  236  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  34.55 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  35.34 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  34.77 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  36.89 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  35.73 
 
 		 416 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  37.44 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 		 423 aa  233  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  34.72 
 
 		 408 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  35.04 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  35.59 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  35.96 
 
 		 416 aa  229  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  34.72 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  35.49 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  33.73 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  36.19 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  41 
 
 		 432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  37.56 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  39.38 
 
 		 443 aa  226  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  36.9 
 
 		 415 aa  226  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.73 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.65 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  39.23 
 
 		 433 aa  223  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  38.56 
 
 		 429 aa  223  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  37.2 
 
 		 425 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.06 
 
 		 431 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  35.17 
 
 		 416 aa  219  5e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  35.42 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  38.36 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  39.61 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  38.97 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  34.62 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  39.39 
 
 		 424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  31.88 
 
 		 424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  37.87 
 
 		 431 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.17 
 
 		 430 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.69 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  32.28 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  32.68 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  35.15 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  32.28 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  32.28 
 
 		 412 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  32.28 
 
 		 412 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  31.96 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  32.04 
 
 		 412 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  31.28 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>