More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3616 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 416 aa  850    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  39.13 
 
 		 411 aa  279  6e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  37.91 
 
 		 411 aa  256  5e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  35.32 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  35.45 
 
 		 413 aa  244  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  33.09 
 
 		 415 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  33.82 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  35.01 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  33.73 
 
 		 415 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  37.99 
 
 		 412 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  35.42 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  37.15 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  37.24 
 
 		 412 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  34.62 
 
 		 406 aa  226  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  37.43 
 
 		 412 aa  225  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  36.96 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  35.25 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  37.43 
 
 		 412 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  35.56 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  37.43 
 
 		 412 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  37.43 
 
 		 412 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  37.43 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  37.43 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  32.93 
 
 		 412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  38.06 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  32.45 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  36.01 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  34.97 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  33.73 
 
 		 432 aa  213  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  33.25 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  36.03 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  33.96 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  33.81 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  32.54 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  33.17 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  33.97 
 
 		 416 aa  202  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  33.52 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  35.53 
 
 		 416 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  31.52 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  31.58 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  36.32 
 
 		 423 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  33.57 
 
 		 418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  31.08 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  32.69 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  33.98 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  30.19 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  35.04 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  33.1 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  42.46 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.15 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  36.78 
 
 		 414 aa  193  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  35.48 
 
 		 438 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  40.84 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  35.29 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  33.49 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  35.85 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  34.82 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.57 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  39.93 
 
 		 393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  33.81 
 
 		 419 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  33.02 
 
 		 443 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  31.83 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  33.65 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  31.5 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  29.38 
 
 		 417 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  31.96 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.14 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  30.29 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  32.21 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  33.41 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  28.88 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  35.16 
 
 		 417 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  30.45 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  31.44 
 
 		 424 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  30.15 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  32.69 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  32.58 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  34.63 
 
 		 408 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  31.19 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  33.17 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  33.97 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  31.9 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  30.84 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 412 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.75 
 
 		 424 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  33.09 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  34.46 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  34.64 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  34.81 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  27.83 
 
 		 408 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  32.61 
 
 		 414 aa  170  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  31.26 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  34.35 
 
 		 408 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.65 
 
 		 401 aa  169  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  32.93 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  29.29 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.27 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  32.59 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.12 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  30.4 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>