More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2707 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  99.52 
 
 
421 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  100 
 
 
421 aa  824    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  100 
 
 
421 aa  824    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  76.01 
 
 
422 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  72.75 
 
 
430 aa  618  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  77.67 
 
 
422 aa  599  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  62.85 
 
 
447 aa  496  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  60.24 
 
 
426 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  55.48 
 
 
434 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  36.56 
 
 
415 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 
414 aa  239  5e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  33.64 
 
 
411 aa  233  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  38.21 
 
 
414 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  37.02 
 
 
420 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  39.68 
 
 
420 aa  222  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  38.3 
 
 
414 aa  220  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  34.43 
 
 
413 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  36.6 
 
 
415 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  31.9 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  33.72 
 
 
415 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  34.11 
 
 
425 aa  216  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  34.27 
 
 
419 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  36.79 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  34.6 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  34.28 
 
 
424 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.96 
 
 
430 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  33.74 
 
 
411 aa  206  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  31.53 
 
 
412 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  31.53 
 
 
412 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  31.53 
 
 
412 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  31.53 
 
 
412 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  32.87 
 
 
412 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  34.6 
 
 
413 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  32.18 
 
 
412 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  36.51 
 
 
416 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  35.66 
 
 
416 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  31.29 
 
 
412 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  31.29 
 
 
412 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  31.06 
 
 
412 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  32.86 
 
 
408 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  31.06 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  32.86 
 
 
408 aa  199  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  33.96 
 
 
420 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  33.57 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  36.09 
 
 
417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  34.84 
 
 
424 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  30.59 
 
 
412 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  37.53 
 
 
418 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  35.08 
 
 
425 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  36.1 
 
 
413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  34.84 
 
 
425 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  34.52 
 
 
430 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  35.99 
 
 
425 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  33.41 
 
 
413 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  31.46 
 
 
403 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  34.84 
 
 
424 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  34.61 
 
 
425 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  30.35 
 
 
412 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  34.67 
 
 
416 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  35.06 
 
 
413 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  35.53 
 
 
424 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  35.51 
 
 
437 aa  193  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  34.21 
 
 
424 aa  192  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  39.56 
 
 
408 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  38.22 
 
 
413 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  35.53 
 
 
424 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  35.2 
 
 
418 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  35.29 
 
 
424 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  37.09 
 
 
413 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  35.1 
 
 
414 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  35.29 
 
 
424 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  34.86 
 
 
416 aa  191  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  33.18 
 
 
424 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  38.42 
 
 
419 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  31.6 
 
 
416 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.37 
 
 
424 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  39.47 
 
 
408 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  39.08 
 
 
408 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  34.26 
 
 
430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  33.41 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  30.07 
 
 
415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  29.18 
 
 
412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  33.41 
 
 
424 aa  182  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  36.91 
 
 
421 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  32.87 
 
 
415 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  31.86 
 
 
417 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  35.85 
 
 
417 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  37.68 
 
 
410 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37 
 
 
429 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  32.8 
 
 
420 aa  179  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  37.8 
 
 
419 aa  179  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
412 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  35.52 
 
 
431 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.25 
 
 
433 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.3 
 
 
429 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  32.64 
 
 
423 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  34.28 
 
 
424 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  30.39 
 
 
418 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
423 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  35.22 
 
 
424 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.045921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>