297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2409 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0886  molybdopterin binding domain-containing protein  72.63 
 
 		 274 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000053068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  61.45 
 
 		 276 aa  328  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1991  molybdopterin binding domain-containing protein  44.32 
 
 		 272 aa  239  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3269  molybdopterin binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  39.25 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  38.36 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  38.52 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  38.25 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  38.07 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  29.89 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  34.56 
 
 		 272 aa  118  7.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.2 
 
 		 413 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.65 
 
 		 408 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  34.12 
 
 		 408 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  31.51 
 
 		 415 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  28.52 
 
 		 415 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  34.12 
 
 		 408 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  30.62 
 
 		 392 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  32.66 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  37.36 
 
 		 401 aa  113  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  32.56 
 
 		 410 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  30.73 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  31.73 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  38.95 
 
 		 438 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  38.5 
 
 		 427 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  34.15 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  32.27 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  33.51 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  40.11 
 
 		 415 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  32.73 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  31.82 
 
 		 411 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  29.73 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  31.56 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  37.91 
 
 		 421 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  30.59 
 
 		 415 aa  105  8e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  37.91 
 
 		 421 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  32.08 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  37.91 
 
 		 421 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  32.65 
 
 		 424 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  38.37 
 
 		 433 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  32.2 
 
 		 418 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  34.46 
 
 		 406 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  29.54 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  27.55 
 
 		 417 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  29.55 
 
 		 415 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  33.33 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  35.26 
 
 		 430 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  36.61 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  36.61 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  36.72 
 
 		 432 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  32.91 
 
 		 372 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  36.46 
 
 		 414 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  32.23 
 
 		 411 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  34.91 
 
 		 420 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  30.9 
 
 		 424 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  29.95 
 
 		 424 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  36.82 
 
 		 413 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  35.16 
 
 		 414 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  30.04 
 
 		 419 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  36.04 
 
 		 422 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  30.04 
 
 		 382 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  33.53 
 
 		 437 aa  96.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  30.2 
 
 		 411 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  35.39 
 
 		 414 aa  96.3  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  37.87 
 
 		 408 aa  96.3  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  32.26 
 
 		 408 aa  95.9  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  30.71 
 
 		 425 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  32.72 
 
 		 419 aa  95.5  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  33.17 
 
 		 424 aa  95.5  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  32.21 
 
 		 416 aa  95.5  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  30.71 
 
 		 425 aa  95.5  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  36.99 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  31.37 
 
 		 425 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.22 
 
 		 401 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.09 
 
 		 431 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  33.14 
 
 		 410 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.77 
 
 		 424 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  33.15 
 
 		 425 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 		 412 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  31.47 
 
 		 416 aa  94  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  32.18 
 
 		 412 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  36.87 
 
 		 426 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.9 
 
 		 429 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  32.76 
 
 		 412 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  34.29 
 
 		 416 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  32.67 
 
 		 413 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  32.76 
 
 		 412 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  32.76 
 
 		 412 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  32.76 
 
 		 412 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  32.76 
 
 		 412 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  30.39 
 
 		 424 aa  92  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  30.3 
 
 		 424 aa  92.4  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  31.8 
 
 		 408 aa  92  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  32.4 
 
 		 430 aa  92  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  32.76 
 
 		 412 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  32.57 
 
 		 416 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  28.28 
 
 		 412 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>