More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1385 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  72.13 
 
 		 258 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  70.9 
 
 		 260 aa  355  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  71.31 
 
 		 258 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  67.65 
 
 		 252 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  68.07 
 
 		 252 aa  332  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  67.23 
 
 		 252 aa  330  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  62.87 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  50.61 
 
 		 255 aa  254  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  55.14 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  55.22 
 
 		 243 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  53.91 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  53.91 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  52.65 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  51.65 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  52.05 
 
 		 245 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  52.94 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  48.84 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  53.09 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  51.48 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  56.16 
 
 		 250 aa  232  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  49.8 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  51.79 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  54.19 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  50 
 
 		 245 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  49.37 
 
 		 245 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  50.2 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  53.78 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  52.99 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  50.21 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  52.65 
 
 		 240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  50 
 
 		 242 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  47.9 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  48.89 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  45.78 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  51.6 
 
 		 242 aa  205  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  50.92 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  47.98 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  45.68 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  43.82 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3949  molybdopterin binding domain protein  38.32 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0493373  normal  0.0572261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2081  molybdopterin binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279418  normal  0.0172334 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  36.62 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  36.97 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  36.02 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1720  molybdopterin binding domain-containing protein  33.91 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2127  molybdopterin binding domain protein  34.35 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2217  molybdopterin binding domain protein  33.91 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.132891  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  37.58 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0288  molybdopterin binding domain protein  41.29 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00336657  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02400  conserved hypothetical protein  34.5 
 
 		 337 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  33.47 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  35.02 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1711  molybdopterin binding domain protein  34.83 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  34.65 
 
 		 391 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  32.64 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  33.91 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  35.68 
 
 		 393 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  36.67 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  30.9 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  32.26 
 
 		 417 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  41.21 
 
 		 414 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  30.47 
 
 		 399 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2333  molybdopterin binding domain protein  32.71 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.651571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  31.28 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  37.91 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  35.67 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  31.15 
 
 		 412 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  33.47 
 
 		 395 aa  98.6  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  37.95 
 
 		 423 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1918  molybdopterin binding domain protein  30.43 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3847  molybdopterin binding domain protein  29.82 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  37.06 
 
 		 413 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  34.24 
 
 		 423 aa  96.3  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  35.98 
 
 		 432 aa  95.9  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  33.73 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  38.82 
 
 		 414 aa  95.5  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0887  molybdopterin binding domain protein  29.77 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  28.96 
 
 		 412 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  29.51 
 
 		 412 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3424  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000022543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  29.41 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  31.78 
 
 		 372 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  30.05 
 
 		 412 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  32.64 
 
 		 416 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  34.39 
 
 		 408 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1894  hypothetical protein  28.33 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1568  molybdopterin binding domain  28.33 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557725 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.16 
 
 		 401 aa  92  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  28.96 
 
 		 412 aa  91.7  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1922  molybdopterin binding domain protein  30.51 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  28.96 
 
 		 412 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  28.96 
 
 		 412 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  28.96 
 
 		 412 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  28.96 
 
 		 412 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  30.05 
 
 		 412 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>