More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2583 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  93 
 
 
243 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  68.22 
 
 
240 aa  332  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  68.33 
 
 
242 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  63.22 
 
 
242 aa  308  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  57.6 
 
 
258 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  55.31 
 
 
252 aa  247  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  53.78 
 
 
258 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  51.44 
 
 
252 aa  245  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  53.81 
 
 
246 aa  245  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  54.87 
 
 
252 aa  244  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  54.26 
 
 
253 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  57.41 
 
 
246 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  55.76 
 
 
260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  50.43 
 
 
255 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  51.91 
 
 
246 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  51.91 
 
 
255 aa  225  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  51.68 
 
 
250 aa  224  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  49.59 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  50.21 
 
 
250 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  49.36 
 
 
245 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  51.91 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  48.52 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  51.75 
 
 
245 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  48.94 
 
 
246 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  49.56 
 
 
245 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  48.51 
 
 
245 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  48.51 
 
 
246 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  47.52 
 
 
259 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  47.7 
 
 
260 aa  205  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  48.28 
 
 
253 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  48.98 
 
 
250 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  50.68 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  51.82 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  51.79 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  50.21 
 
 
253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  47.84 
 
 
254 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  51.83 
 
 
245 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  49.77 
 
 
256 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3949  molybdopterin binding domain protein  35.68 
 
 
249 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0493373  normal  0.0572261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1720  molybdopterin binding domain-containing protein  37.93 
 
 
250 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2127  molybdopterin binding domain protein  37.93 
 
 
250 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2217  molybdopterin binding domain protein  37.5 
 
 
250 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.132891  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0288  molybdopterin binding domain protein  41.15 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00336657  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  38.46 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02400  conserved hypothetical protein  34.26 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2081  molybdopterin binding domain-containing protein  33.48 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279418  normal  0.0172334 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  32.64 
 
 
260 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  39.57 
 
 
423 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1922  molybdopterin binding domain protein  35.17 
 
 
249 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
251 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  39.76 
 
 
395 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  36.36 
 
 
262 aa  105  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  34.76 
 
 
265 aa  105  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1711  molybdopterin binding domain protein  34.83 
 
 
231 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  34.55 
 
 
257 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  39.26 
 
 
391 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
410 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  38.65 
 
 
393 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  30.67 
 
 
248 aa  101  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  34.88 
 
 
400 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  35.37 
 
 
272 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2077  hypothetical protein  33.47 
 
 
269 aa  99.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  36.61 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922318  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  35.09 
 
 
282 aa  99.4  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  31.93 
 
 
268 aa  98.6  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
251 aa  98.2  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  31.44 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0357  molybdopterin binding domain-containing protein  32.79 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0528252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  40.72 
 
 
414 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  35.67 
 
 
423 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1918  molybdopterin binding domain protein  29.46 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  33.64 
 
 
392 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3847  molybdopterin binding domain protein  27.5 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0932  molybdopterin binding domain protein  32.46 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452634  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1180  molybdopterin binding domain protein  35.12 
 
 
249 aa  95.1  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  31.49 
 
 
273 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  35.06 
 
 
415 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  35.06 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3424  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
254 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000022543  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2333  molybdopterin binding domain protein  29.74 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.651571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  35.26 
 
 
408 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  34.38 
 
 
408 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  35.14 
 
 
273 aa  93.6  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  33.13 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  34.84 
 
 
410 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  33.75 
 
 
408 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  30.64 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.97 
 
 
401 aa  92.4  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0725  molybdopterin binding domain protein  31.16 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  35.76 
 
 
415 aa  92  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  34.86 
 
 
413 aa  92  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  28.51 
 
 
228 aa  92  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02736  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  91.7  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  29.41 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  29.29 
 
 
412 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3580  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  31.07 
 
 
416 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  31.49 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>