More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2992 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  93 
 
 
243 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  93 
 
 
243 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  66.95 
 
 
240 aa  327  9e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  66.25 
 
 
242 aa  311  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  63.22 
 
 
242 aa  310  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  53.09 
 
 
252 aa  255  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  54.62 
 
 
258 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  57.6 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  56.19 
 
 
252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  56.05 
 
 
253 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  55.75 
 
 
252 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  59.26 
 
 
246 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  57.14 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  52.97 
 
 
246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  52.97 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  51.91 
 
 
246 aa  234  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  52.34 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  50.21 
 
 
245 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  51.26 
 
 
250 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  48.95 
 
 
245 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  52.86 
 
 
252 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  50.88 
 
 
245 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  52.32 
 
 
246 aa  224  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  50.21 
 
 
250 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  51.75 
 
 
245 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  49.36 
 
 
245 aa  218  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  49.36 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  49.8 
 
 
250 aa  214  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  53.64 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  50 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  52.49 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  47.93 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  53.21 
 
 
245 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  48.12 
 
 
260 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  48.51 
 
 
246 aa  210  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  52.23 
 
 
250 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  51.5 
 
 
253 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  49.14 
 
 
254 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  50.45 
 
 
256 aa  198  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3949  molybdopterin binding domain protein  35.21 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0493373  normal  0.0572261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1720  molybdopterin binding domain-containing protein  37.07 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0288  molybdopterin binding domain protein  40.67 
 
 
249 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00336657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2127  molybdopterin binding domain protein  37.07 
 
 
250 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2217  molybdopterin binding domain protein  36.64 
 
 
250 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.132891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2081  molybdopterin binding domain-containing protein  33.92 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279418  normal  0.0172334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  36.54 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02400  conserved hypothetical protein  33.2 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  34.76 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  34.91 
 
 
262 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  38.5 
 
 
423 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1922  molybdopterin binding domain protein  34.32 
 
 
249 aa  106  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1711  molybdopterin binding domain protein  35.32 
 
 
231 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  31.88 
 
 
228 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  32.91 
 
 
251 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  30.54 
 
 
260 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  34.3 
 
 
272 aa  102  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  30.67 
 
 
248 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  37.35 
 
 
395 aa  99.8  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  32.69 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
257 aa  99.4  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 
391 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  34.13 
 
 
400 aa  99.4  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  28.95 
 
 
228 aa  99  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  32.85 
 
 
251 aa  98.6  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  32.37 
 
 
392 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  38.56 
 
 
393 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1918  molybdopterin binding domain protein  29.05 
 
 
248 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0357  molybdopterin binding domain-containing protein  31.98 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0528252 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  37.35 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2333  molybdopterin binding domain protein  29.31 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.651571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  30.67 
 
 
268 aa  95.5  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  35 
 
 
408 aa  95.1  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  35 
 
 
408 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  34.59 
 
 
273 aa  94.4  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  34.38 
 
 
408 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  29.58 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0887  molybdopterin binding domain protein  28.92 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  30.9 
 
 
272 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0725  molybdopterin binding domain protein  31.63 
 
 
251 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0932  molybdopterin binding domain protein  31.72 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452634  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  34.19 
 
 
410 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1773  putative molybdopterin binding protein  32 
 
 
410 aa  92.4  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3847  molybdopterin binding domain protein  26.67 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  35.71 
 
 
415 aa  92  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  38.92 
 
 
414 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  34.97 
 
 
275 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  35.71 
 
 
413 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  30.21 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  29.91 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2077  hypothetical protein  31.88 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  30.64 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  28.45 
 
 
412 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  28.87 
 
 
412 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  35.75 
 
 
413 aa  89.4  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  35.85 
 
 
423 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  32.54 
 
 
415 aa  89.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  31.88 
 
 
399 aa  89.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  28.15 
 
 
417 aa  89.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0871  CinA family protein  35.15 
 
 
415 aa  89  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.02353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>