More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5271 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  84.9 
 
 
245 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  84.71 
 
 
245 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  83.67 
 
 
245 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  82.86 
 
 
245 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  77.64 
 
 
246 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  78.28 
 
 
246 aa  388  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  64.71 
 
 
250 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  60.33 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  60.74 
 
 
246 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  61.92 
 
 
250 aa  268  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  56.72 
 
 
259 aa  265  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  60.58 
 
 
245 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  55.56 
 
 
246 aa  258  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  55.14 
 
 
260 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  60.5 
 
 
250 aa  252  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  61.36 
 
 
245 aa  251  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  56.49 
 
 
246 aa  249  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  53.09 
 
 
254 aa  248  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  53.53 
 
 
252 aa  244  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  55.88 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  49.59 
 
 
255 aa  241  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  51.87 
 
 
252 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  51.45 
 
 
252 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  55.88 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  54.5 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  52.07 
 
 
253 aa  221  9e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  49.36 
 
 
243 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  48.09 
 
 
242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  47.98 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  49.79 
 
 
253 aa  211  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  50.44 
 
 
240 aa  211  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  48.74 
 
 
255 aa  208  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  48.51 
 
 
243 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  48.51 
 
 
243 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  49.15 
 
 
256 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  46.67 
 
 
246 aa  204  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  45.42 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  52.27 
 
 
242 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  45 
 
 
252 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02400  conserved hypothetical protein  37.28 
 
 
337 aa  135  7.000000000000001e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3949  molybdopterin binding domain protein  36.49 
 
 
249 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0493373  normal  0.0572261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0288  molybdopterin binding domain protein  35.06 
 
 
249 aa  122  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00336657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2217  molybdopterin binding domain protein  35.5 
 
 
250 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.132891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1720  molybdopterin binding domain-containing protein  35.06 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2127  molybdopterin binding domain protein  35.5 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2081  molybdopterin binding domain-containing protein  35.38 
 
 
248 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279418  normal  0.0172334 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  31.76 
 
 
248 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  30.3 
 
 
228 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  32.14 
 
 
265 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  32.08 
 
 
268 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  32.86 
 
 
246 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  30.13 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  33.13 
 
 
272 aa  99  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  33.5 
 
 
251 aa  98.6  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3847  molybdopterin binding domain protein  29.36 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  33.49 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  35.67 
 
 
391 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1568  molybdopterin binding domain  29.96 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000557725 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1894  hypothetical protein  29.96 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1180  molybdopterin binding domain protein  32.2 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  34.21 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1922  molybdopterin binding domain protein  32.33 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  29.24 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0932  molybdopterin binding domain protein  31.73 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452634  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  32.76 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5003  molybdopterin binding domain-containing protein  30.47 
 
 
272 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92537  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  28.22 
 
 
248 aa  91.7  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1631  molybdopterin binding domain protein  32.53 
 
 
266 aa  91.7  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  30.91 
 
 
282 aa  91.7  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2978  molybdopterin binding domain-containing protein  30.31 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1918  molybdopterin binding domain protein  31.28 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  31.58 
 
 
415 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  28.64 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  34.52 
 
 
395 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  33.92 
 
 
393 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  31.47 
 
 
372 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  36.75 
 
 
273 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1084  molybdopterin binding domain  33.73 
 
 
272 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444245  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12894  predicted protein  36.64 
 
 
403 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.894493  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  30.3 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1256  molybdopterin binding domain-containing protein  34.97 
 
 
287 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0896823  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  34.94 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2077  hypothetical protein  31.1 
 
 
269 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
418 aa  87  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1108  molybdopterin binding domain protein  30.97 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  35.54 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1176  molybdopterin binding domain protein  33.73 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1188  molybdopterin binding domain-containing protein  30.97 
 
 
273 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.457563 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2333  molybdopterin binding domain protein  28.14 
 
 
230 aa  86.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.651571 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.78 
 
 
431 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  31.33 
 
 
408 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3424  molybdopterin binding domain-containing protein  31.82 
 
 
254 aa  85.1  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000022543  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  32.34 
 
 
419 aa  85.1  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  30.22 
 
 
424 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  27.65 
 
 
275 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922318  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0044  molybdopterin binding domain protein  27.87 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2617  molybdopterin binding domain  34.73 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  normal  0.647979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  33.73 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1483  molybdopterin binding domain-containing protein  33.53 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>