More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2472 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  91.43 
 
 		 245 aa  453  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  90.61 
 
 		 245 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  87.24 
 
 		 245 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  84.9 
 
 		 245 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  78.05 
 
 		 246 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  78.19 
 
 		 246 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  63.87 
 
 		 250 aa  289  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  62.81 
 
 		 250 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  63.79 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  63.64 
 
 		 250 aa  278  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  56.67 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  59.92 
 
 		 245 aa  258  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  61.67 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  53.97 
 
 		 259 aa  248  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  61.82 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  52.44 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  52.89 
 
 		 252 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  53.47 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  54.11 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  53.47 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  50.83 
 
 		 252 aa  235  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  53.6 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  50.41 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  50.21 
 
 		 243 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  52.67 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  50.63 
 
 		 253 aa  218  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  49.36 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  50.42 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  50.21 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  49.36 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  48.31 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  46.38 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  47.3 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  48.78 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  47.01 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  51.36 
 
 		 242 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  45.96 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02400  conserved hypothetical protein  35.53 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3949  molybdopterin binding domain protein  35.58 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0493373  normal  0.0572261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2081  molybdopterin binding domain-containing protein  35.1 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279418  normal  0.0172334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  37.02 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0288  molybdopterin binding domain protein  36.59 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00336657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2217  molybdopterin binding domain protein  34.48 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.132891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1720  molybdopterin binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2127  molybdopterin binding domain protein  34.48 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 268 aa  109  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  33.33 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1180  molybdopterin binding domain protein  34.48 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  30.51 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  35.98 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5003  molybdopterin binding domain-containing protein  32.3 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3847  molybdopterin binding domain protein  31.49 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  35.5 
 
 		 391 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  32.52 
 
 		 415 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  35.95 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1894  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1568  molybdopterin binding domain  30 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1084  molybdopterin binding domain  34.34 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  35.54 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  31.98 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  35.54 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  33.81 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  31.58 
 
 		 372 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  28.03 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1631  molybdopterin binding domain protein  29.64 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  29.44 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1176  molybdopterin binding domain protein  34.34 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  32.53 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1922  molybdopterin binding domain protein  31.97 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2617  molybdopterin binding domain  34.73 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  normal  0.647979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  33.73 
 
 		 393 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0044  molybdopterin binding domain protein  30.66 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1918  molybdopterin binding domain protein  33.02 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1483  molybdopterin binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 277 aa  92  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.13 
 
 		 408 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0932  molybdopterin binding domain protein  31.75 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  30.81 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  30.45 
 
 		 408 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1256  molybdopterin binding domain-containing protein  34.36 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0896823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2077  hypothetical protein  30.71 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1519  hypothetical protein  33.53 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495603  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  34.15 
 
 		 412 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12894  predicted protein  36.64 
 
 		 403 aa  90.1  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.894493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  36.14 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5926  molybdopterin binding domain-containing protein  35 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2169  molybdopterin binding domain-containing protein  35 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2151  molybdopterin binding domain-containing protein  35 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435728  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  32.38 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2978  molybdopterin binding domain-containing protein  30.59 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1108  molybdopterin binding domain protein  31.25 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  35.12 
 
 		 395 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  34.23 
 
 		 408 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1188  molybdopterin binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.457563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1842  molybdopterin-binding protein  35.62 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5460  molybdopterin binding protein  34.38 
 
 		 271 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1120  molybdopterin binding domain-containing protein  35 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.501454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>