More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2241 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  92.65 
 
 		 245 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  90.61 
 
 		 245 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  86.36 
 
 		 245 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  82.86 
 
 		 245 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  77.78 
 
 		 246 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  75.61 
 
 		 246 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  64.98 
 
 		 250 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  61.51 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  61.09 
 
 		 246 aa  268  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  58.82 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  55.04 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  53.91 
 
 		 246 aa  248  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  51.87 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  55.65 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  60.83 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  58.82 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  55.04 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  52.26 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  51.85 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  51.25 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  54.96 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  51.46 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  48.95 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  51.35 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  48.95 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  51.65 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  47.26 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  48.52 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  48.52 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  48.75 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  51.82 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  45.75 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  48.51 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  47.5 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  48.98 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  45.23 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  45 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  49.55 
 
 		 242 aa  184  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3949  molybdopterin binding domain protein  35.89 
 
 		 249 aa  131  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0493373  normal  0.0572261 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02400  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2081  molybdopterin binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279418  normal  0.0172334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2217  molybdopterin binding domain protein  33.92 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.132891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2127  molybdopterin binding domain protein  33.92 
 
 		 250 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1720  molybdopterin binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0288  molybdopterin binding domain protein  34 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00336657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  37.66 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  35.37 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5003  molybdopterin binding domain-containing protein  32.3 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  29.24 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1568  molybdopterin binding domain  30.5 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557725 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1894  hypothetical protein  30.5 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1180  molybdopterin binding domain protein  32.51 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  35.95 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  34.91 
 
 		 391 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  27.8 
 
 		 248 aa  95.9  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  31.93 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3847  molybdopterin binding domain protein  28.51 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  31.45 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  31.28 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12894  predicted protein  38.28 
 
 		 403 aa  92.8  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.894493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  34.94 
 
 		 272 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0044  molybdopterin binding domain protein  28.98 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  35.06 
 
 		 415 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0932  molybdopterin binding domain protein  30.77 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1084  molybdopterin binding domain  33.73 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2617  molybdopterin binding domain  34.73 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  normal  0.647979 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  27.51 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.13 
 
 		 408 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  36.14 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  30.21 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2978  molybdopterin binding domain-containing protein  31.89 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1483  molybdopterin binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 277 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  32.54 
 
 		 393 aa  89  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  29.64 
 
 		 372 aa  88.6  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1176  molybdopterin binding domain protein  33.73 
 
 		 272 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1256  molybdopterin binding domain-containing protein  34.36 
 
 		 287 aa  88.6  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0896823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1631  molybdopterin binding domain protein  31.22 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  28.57 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  34.9 
 
 		 408 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.16 
 
 		 431 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1519  hypothetical protein  33.53 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495603  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  31 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  34.52 
 
 		 395 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  34.23 
 
 		 408 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2077  hypothetical protein  29.92 
 
 		 269 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3424  molybdopterin binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000022543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2169  molybdopterin binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  32.93 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5926  molybdopterin binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  30.48 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2151  molybdopterin binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435728  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1922  molybdopterin binding domain protein  30 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  28.57 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1842  molybdopterin-binding protein  35 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>