More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2978 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2978  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1631  molybdopterin binding domain protein  74.05 
 
 		 266 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1806  molybdopterin binding domain-containing protein  73.26 
 
 		 274 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1441  molybdopterin binding domain-containing protein  68.86 
 
 		 275 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2781  molybdopterin binding domain-containing protein  66.78 
 
 		 302 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3155  molybdopterin binding domain-containing protein  67.41 
 
 		 273 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1188  molybdopterin binding domain-containing protein  65.19 
 
 		 273 aa  351  7e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.457563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5003  molybdopterin binding domain-containing protein  66.42 
 
 		 272 aa  349  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1108  molybdopterin binding domain protein  64.81 
 
 		 273 aa  348  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2077  hypothetical protein  67.54 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3580  molybdopterin binding domain-containing protein  70.23 
 
 		 264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1483  molybdopterin binding domain-containing protein  61.83 
 
 		 277 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1519  hypothetical protein  62.6 
 
 		 279 aa  323  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495603  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5460  molybdopterin binding protein  64.57 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2188  molybdopterin binding domain-containing protein  63.78 
 
 		 271 aa  321  8e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2061  molybdopterin binding domain-containing protein  63.78 
 
 		 271 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2169  molybdopterin binding domain-containing protein  63.78 
 
 		 271 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2617  molybdopterin binding domain  61.83 
 
 		 278 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  normal  0.647979 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5926  molybdopterin binding domain-containing protein  63.78 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2151  molybdopterin binding domain-containing protein  63.78 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1120  molybdopterin binding domain-containing protein  64.17 
 
 		 272 aa  319  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.501454 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1745  molybdopterin-binding protein  63.39 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2772  molybdopterin binding domain-containing protein  63.39 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3065  molybdopterin-binding protein  63.39 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2255  molybdopterin-binding protein  63.39 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2693  molybdopterin binding protein  63.39 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.708984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1526  molybdopterin-binding protein  63.39 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1842  molybdopterin-binding protein  63.39 
 
 		 272 aa  315  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2637  molybdopterin binding protein  63.39 
 
 		 272 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.175623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  60.3 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  57.46 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1256  molybdopterin binding domain-containing protein  57.68 
 
 		 287 aa  298  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0896823  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1084  molybdopterin binding domain  60.47 
 
 		 272 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1176  molybdopterin binding domain protein  59 
 
 		 272 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  57.84 
 
 		 273 aa  291  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0695  molybdopterin binding domain  58.05 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.790264 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  51.35 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1180  molybdopterin binding domain protein  53.85 
 
 		 249 aa  241  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  48.18 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0357  molybdopterin binding domain-containing protein  50.58 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0528252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3424  molybdopterin binding domain-containing protein  46.85 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000022543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  46.15 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  45.53 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  43.02 
 
 		 248 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  40.82 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0044  molybdopterin binding domain protein  42.91 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1894  hypothetical protein  40.64 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1568  molybdopterin binding domain  40.64 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557725 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  37.84 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0651  molybdopterin binding domain protein  39.55 
 
 		 245 aa  112  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0438465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  30.31 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  33.33 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  32.16 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  31.86 
 
 		 245 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  32.11 
 
 		 256 aa  99.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  31.86 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  31.65 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  31.09 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  29.39 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  30.98 
 
 		 246 aa  95.5  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  30.31 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  29.24 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  31.05 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  31.89 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1090  molybdopterin binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 243 aa  89.7  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  30.59 
 
 		 245 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  28.39 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  29.39 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  32.64 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  32.75 
 
 		 408 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  32.75 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  31.89 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  30.81 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  27.43 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  32.37 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  32.37 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  32.16 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  31.73 
 
 		 414 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  28.17 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  28.46 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  31.98 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  33.73 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  29.67 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  31.49 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  31.49 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  31.98 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  28.4 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  29.65 
 
 		 412 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  29.05 
 
 		 415 aa  79  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  32.7 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>