More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1256 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1256  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0896823  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0695  molybdopterin binding domain  93.09 
 
 		 246 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.790264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  62.45 
 
 		 266 aa  355  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1084  molybdopterin binding domain  63.88 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1176  molybdopterin binding domain protein  63.88 
 
 		 272 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  63.46 
 
 		 273 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  63.98 
 
 		 272 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1483  molybdopterin binding domain-containing protein  60.69 
 
 		 277 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2617  molybdopterin binding domain  61.45 
 
 		 278 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  normal  0.647979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1519  hypothetical protein  61.07 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495603  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1120  molybdopterin binding domain-containing protein  62.35 
 
 		 272 aa  325  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.501454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5460  molybdopterin binding protein  60.63 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1842  molybdopterin-binding protein  61.81 
 
 		 272 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1526  molybdopterin-binding protein  62.35 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1745  molybdopterin-binding protein  62.35 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2772  molybdopterin binding domain-containing protein  62.35 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2693  molybdopterin binding protein  62.35 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.708984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3065  molybdopterin-binding protein  62.35 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2255  molybdopterin-binding protein  62.35 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2169  molybdopterin binding domain-containing protein  60.63 
 
 		 271 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2637  molybdopterin binding protein  62.35 
 
 		 272 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.175623  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5926  molybdopterin binding domain-containing protein  60.63 
 
 		 271 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2151  molybdopterin binding domain-containing protein  60.63 
 
 		 271 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435728  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2061  molybdopterin binding domain-containing protein  60.24 
 
 		 271 aa  321  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2188  molybdopterin binding domain-containing protein  59.84 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2978  molybdopterin binding domain-containing protein  57.68 
 
 		 274 aa  298  8e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1631  molybdopterin binding domain protein  57.25 
 
 		 266 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3580  molybdopterin binding domain-containing protein  58.51 
 
 		 264 aa  278  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1441  molybdopterin binding domain-containing protein  52.63 
 
 		 275 aa  278  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1188  molybdopterin binding domain-containing protein  53.61 
 
 		 273 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.457563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3155  molybdopterin binding domain-containing protein  53.23 
 
 		 273 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2077  hypothetical protein  55.43 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1108  molybdopterin binding domain protein  53.23 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5003  molybdopterin binding domain-containing protein  54.48 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1806  molybdopterin binding domain-containing protein  54.48 
 
 		 274 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2781  molybdopterin binding domain-containing protein  50.51 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1180  molybdopterin binding domain protein  49.05 
 
 		 249 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3424  molybdopterin binding domain-containing protein  46.59 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000022543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  44.91 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  43.89 
 
 		 246 aa  218  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0357  molybdopterin binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0528252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  42.05 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  39.84 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1894  hypothetical protein  37.12 
 
 		 250 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1568  molybdopterin binding domain  37.12 
 
 		 250 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557725 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0044  molybdopterin binding domain protein  39.6 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  41.47 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  32.41 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  31.42 
 
 		 253 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  29.18 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  34.66 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  33.18 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  34.29 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0651  molybdopterin binding domain protein  31.46 
 
 		 245 aa  95.5  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0438465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  32.34 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1090  molybdopterin binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 243 aa  92.4  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 250 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  29.52 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  36.2 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  35.71 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  34.36 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  32.77 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  32.77 
 
 		 252 aa  90.1  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 246 aa  89  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 255 aa  89  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  34.97 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  34.36 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  33.93 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  29.91 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  31.02 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  34.97 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  31.02 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.12 
 
 		 408 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 243 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  34.36 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  33.12 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  33.12 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  28.06 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  32.09 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  28.95 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  31.84 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  32.52 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  28.34 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  31.33 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  28.99 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0886  molybdopterin binding domain-containing protein  26.2 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000053068  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  27.8 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  32.7 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>