278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1090 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1090  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0651  molybdopterin binding domain protein  46.38 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0438465  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0044  molybdopterin binding domain protein  40.16 
 
 
262 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1894  hypothetical protein  35.44 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1568  molybdopterin binding domain  35.44 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000557725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  35.2 
 
 
246 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  35.1 
 
 
248 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  36.61 
 
 
251 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  40.74 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  35.16 
 
 
260 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  42.17 
 
 
268 aa  128  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0357  molybdopterin binding domain-containing protein  36.67 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0528252 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  32.38 
 
 
248 aa  115  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1180  molybdopterin binding domain protein  36.16 
 
 
249 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5003  molybdopterin binding domain-containing protein  31.52 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92537  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3580  molybdopterin binding domain-containing protein  33.78 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1806  molybdopterin binding domain-containing protein  31.09 
 
 
274 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2617  molybdopterin binding domain  37.02 
 
 
278 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  normal  0.647979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1631  molybdopterin binding domain protein  30.15 
 
 
266 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1519  hypothetical protein  36.11 
 
 
279 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495603  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3424  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
254 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000022543  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  31.42 
 
 
273 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1483  molybdopterin binding domain-containing protein  32.46 
 
 
277 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916482  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2077  hypothetical protein  29.84 
 
 
269 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1108  molybdopterin binding domain protein  30.54 
 
 
273 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1188  molybdopterin binding domain-containing protein  30.54 
 
 
273 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.457563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1084  molybdopterin binding domain  33.04 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444245  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  31.56 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1176  molybdopterin binding domain protein  33.19 
 
 
272 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1441  molybdopterin binding domain-containing protein  30.7 
 
 
275 aa  95.9  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1256  molybdopterin binding domain-containing protein  32.58 
 
 
287 aa  92.4  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0896823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  30.53 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2169  molybdopterin binding domain-containing protein  31.94 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5926  molybdopterin binding domain-containing protein  31.94 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2151  molybdopterin binding domain-containing protein  31.94 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1120  molybdopterin binding domain-containing protein  31.94 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.501454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1842  molybdopterin-binding protein  31.48 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2978  molybdopterin binding domain-containing protein  29.27 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2637  molybdopterin binding protein  31.48 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.175623  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1745  molybdopterin-binding protein  31.48 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1526  molybdopterin-binding protein  31.48 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2772  molybdopterin binding domain-containing protein  31.48 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2693  molybdopterin binding protein  31.48 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.708984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2255  molybdopterin-binding protein  31.48 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3065  molybdopterin-binding protein  31.48 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645561  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3155  molybdopterin binding domain-containing protein  29.36 
 
 
273 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2188  molybdopterin binding domain-containing protein  31.02 
 
 
271 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5460  molybdopterin binding protein  31.48 
 
 
271 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2061  molybdopterin binding domain-containing protein  30.56 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2781  molybdopterin binding domain-containing protein  25.42 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  29.55 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  30 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  30 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  31.01 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  25.33 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  29.03 
 
 
416 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  27.49 
 
 
416 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  27.49 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  26.2 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  26.46 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  28.4 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  29.09 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  27.61 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  26.99 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.43 
 
 
431 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  25 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  27.75 
 
 
432 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  28.14 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  28.66 
 
 
416 aa  68.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  24.17 
 
 
401 aa  68.6  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  28.4 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0695  molybdopterin binding domain  29.29 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.790264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  28.4 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  24.05 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  26.47 
 
 
282 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0932  molybdopterin binding domain protein  26.11 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452634  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  27.49 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  26.06 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  29.45 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  27.49 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  27.74 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  27.87 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  27.61 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  26.64 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  28.48 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  27.12 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  23 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  26.29 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.6 
 
 
429 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  25.21 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  24.58 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0887  molybdopterin binding domain protein  26.34 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  25.54 
 
 
420 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.6 
 
 
401 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  26.29 
 
 
421 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  25.88 
 
 
425 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  27.47 
 
 
417 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1922  molybdopterin binding domain protein  26.49 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  28.24 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  28.87 
 
 
434 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>