293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1631 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1631  molybdopterin binding domain protein  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2978  molybdopterin binding domain-containing protein  74.05 
 
 		 274 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1806  molybdopterin binding domain-containing protein  73.36 
 
 		 274 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1441  molybdopterin binding domain-containing protein  69.03 
 
 		 275 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1188  molybdopterin binding domain-containing protein  69.37 
 
 		 273 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.457563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3155  molybdopterin binding domain-containing protein  69 
 
 		 273 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1108  molybdopterin binding domain protein  69 
 
 		 273 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2781  molybdopterin binding domain-containing protein  65.89 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5003  molybdopterin binding domain-containing protein  67.78 
 
 		 272 aa  358  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2077  hypothetical protein  68.66 
 
 		 269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3580  molybdopterin binding domain-containing protein  69.85 
 
 		 264 aa  349  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1483  molybdopterin binding domain-containing protein  64.2 
 
 		 277 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1519  hypothetical protein  64.59 
 
 		 279 aa  322  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495603  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2617  molybdopterin binding domain  63.81 
 
 		 278 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  normal  0.647979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1842  molybdopterin-binding protein  65.73 
 
 		 272 aa  319  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1745  molybdopterin-binding protein  65.32 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2772  molybdopterin binding domain-containing protein  65.32 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3065  molybdopterin-binding protein  65.32 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1526  molybdopterin-binding protein  65.32 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2693  molybdopterin binding protein  65.32 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.708984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2255  molybdopterin-binding protein  65.32 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2637  molybdopterin binding protein  65.32 
 
 		 272 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.175623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2169  molybdopterin binding domain-containing protein  64.92 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5926  molybdopterin binding domain-containing protein  64.92 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2151  molybdopterin binding domain-containing protein  64.92 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5460  molybdopterin binding protein  64.92 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1120  molybdopterin binding domain-containing protein  64.52 
 
 		 272 aa  309  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.501454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2188  molybdopterin binding domain-containing protein  63.71 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2061  molybdopterin binding domain-containing protein  63.71 
 
 		 271 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  58.43 
 
 		 272 aa  295  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1084  molybdopterin binding domain  59.84 
 
 		 272 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1176  molybdopterin binding domain protein  59.84 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  59.77 
 
 		 266 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  58.98 
 
 		 273 aa  288  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1256  molybdopterin binding domain-containing protein  57.25 
 
 		 287 aa  281  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0896823  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0695  molybdopterin binding domain  55.56 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.790264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1180  molybdopterin binding domain protein  50.64 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  48.82 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  46.74 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0357  molybdopterin binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0528252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3424  molybdopterin binding domain-containing protein  44.88 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000022543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  44.96 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  41.8 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  44.08 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  39.44 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0044  molybdopterin binding domain protein  41.73 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1894  hypothetical protein  40.64 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1568  molybdopterin binding domain  40.64 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557725 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  32.92 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  33.6 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1090  molybdopterin binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 243 aa  102  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0651  molybdopterin binding domain protein  33.71 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0438465  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  30.73 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 246 aa  98.6  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  30.98 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  30.73 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  30.35 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  33.53 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  34.34 
 
 		 240 aa  96.3  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  29.64 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  30.83 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  32.53 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  34.52 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  30.68 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  34.34 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  31.22 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  29.39 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  29.13 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  31.56 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  33.14 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  36.69 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  29.39 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  29.44 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  28.75 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  30.59 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  32.71 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.75 
 
 		 408 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  29.44 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  34.38 
 
 		 408 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  28.69 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  28.69 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  33.75 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  27.64 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  33.96 
 
 		 395 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  30.2 
 
 		 420 aa  75.5  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  32.7 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  28.84 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>