More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2467 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  68.22 
 
 		 243 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  68.22 
 
 		 243 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  66.95 
 
 		 243 aa  327  9e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  66.24 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  70.4 
 
 		 242 aa  301  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  54.13 
 
 		 246 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  56.09 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  57.01 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  56.68 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  51.95 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  47.7 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  52.65 
 
 		 252 aa  231  6e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  52.65 
 
 		 252 aa  231  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  55.04 
 
 		 250 aa  228  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  53.51 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  56.83 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  57.21 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  57.73 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  56.22 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  52.81 
 
 		 260 aa  224  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  51.05 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  53.1 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  52.97 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  55.45 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  51.48 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  50.21 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  50.42 
 
 		 254 aa  214  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  55.67 
 
 		 245 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  51.32 
 
 		 246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  48.51 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  50.67 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  48.52 
 
 		 260 aa  211  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  50.44 
 
 		 245 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  51.05 
 
 		 246 aa  210  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  50.44 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  52.78 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  48.35 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  53.3 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  50.43 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3949  molybdopterin binding domain protein  39.32 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0493373  normal  0.0572261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  35.02 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  38.24 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  35.32 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  33.47 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1720  molybdopterin binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2081  molybdopterin binding domain-containing protein  34.76 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279418  normal  0.0172334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2217  molybdopterin binding domain protein  37.87 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.132891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2127  molybdopterin binding domain protein  37.87 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0288  molybdopterin binding domain protein  37.26 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00336657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  35.61 
 
 		 248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3847  molybdopterin binding domain protein  32.21 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1922  molybdopterin binding domain protein  34.15 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  31.86 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  32.5 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  32.87 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  33.83 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  34.88 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2333  molybdopterin binding domain protein  33 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.651571 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1711  molybdopterin binding domain protein  34.83 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  35.83 
 
 		 423 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1084  molybdopterin binding domain  35.12 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1176  molybdopterin binding domain protein  36.31 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  31.73 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02400  conserved hypothetical protein  30.8 
 
 		 337 aa  101  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1842  molybdopterin-binding protein  36.18 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2978  molybdopterin binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  32.84 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  30.04 
 
 		 424 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0932  molybdopterin binding domain protein  31.28 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2077  hypothetical protein  34.4 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2637  molybdopterin binding protein  36.18 
 
 		 272 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.175623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3065  molybdopterin-binding protein  36.18 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645561  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1745  molybdopterin-binding protein  36.18 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2772  molybdopterin binding domain-containing protein  36.18 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1526  molybdopterin-binding protein  36.18 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2693  molybdopterin binding protein  36.18 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.708984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3580  molybdopterin binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2255  molybdopterin-binding protein  36.18 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  34.34 
 
 		 273 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1483  molybdopterin binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1256  molybdopterin binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0896823  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0887  molybdopterin binding domain protein  29.41 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  32.72 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  35.54 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1120  molybdopterin binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.501454 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  31.73 
 
 		 400 aa  97.1  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1108  molybdopterin binding domain protein  31.13 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1188  molybdopterin binding domain-containing protein  31.13 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.457563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0357  molybdopterin binding domain-containing protein  32.02 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0528252 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  32.73 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2169  molybdopterin binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1631  molybdopterin binding domain protein  34.34 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1519  hypothetical protein  30.23 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495603  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5926  molybdopterin binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2617  molybdopterin binding domain  30.23 
 
 		 278 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  normal  0.647979 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2151  molybdopterin binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1180  molybdopterin binding domain protein  33 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  33.01 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  31.82 
 
 		 424 aa  95.5  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>