291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1176 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1176  molybdopterin binding domain protein  100 
 
 		 272 aa  557  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1084  molybdopterin binding domain  98.9 
 
 		 272 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  90.07 
 
 		 272 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  75.37 
 
 		 273 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  72.83 
 
 		 266 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2617  molybdopterin binding domain  70.15 
 
 		 278 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  normal  0.647979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1519  hypothetical protein  69.89 
 
 		 279 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495603  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1483  molybdopterin binding domain-containing protein  66.79 
 
 		 277 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5460  molybdopterin binding protein  69.85 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2169  molybdopterin binding domain-containing protein  69.47 
 
 		 271 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5926  molybdopterin binding domain-containing protein  69.47 
 
 		 271 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2188  molybdopterin binding domain-containing protein  69.08 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2151  molybdopterin binding domain-containing protein  69.47 
 
 		 271 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435728  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2061  molybdopterin binding domain-containing protein  69.08 
 
 		 271 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1120  molybdopterin binding domain-containing protein  71.15 
 
 		 272 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.501454 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2693  molybdopterin binding protein  70.82 
 
 		 272 aa  361  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.708984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1526  molybdopterin-binding protein  70.82 
 
 		 272 aa  361  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1745  molybdopterin-binding protein  70.82 
 
 		 272 aa  361  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2772  molybdopterin binding domain-containing protein  70.82 
 
 		 272 aa  361  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3065  molybdopterin-binding protein  70.82 
 
 		 272 aa  361  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2255  molybdopterin-binding protein  70.82 
 
 		 272 aa  361  6e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1842  molybdopterin-binding protein  69.92 
 
 		 272 aa  360  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2637  molybdopterin binding protein  70.82 
 
 		 272 aa  360  9e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.175623  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1256  molybdopterin binding domain-containing protein  63.88 
 
 		 287 aa  352  4e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0896823  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0695  molybdopterin binding domain  62.7 
 
 		 246 aa  314  8e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.790264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1631  molybdopterin binding domain protein  59.84 
 
 		 266 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2978  molybdopterin binding domain-containing protein  59 
 
 		 274 aa  291  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3155  molybdopterin binding domain-containing protein  56.93 
 
 		 273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5003  molybdopterin binding domain-containing protein  56.93 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1188  molybdopterin binding domain-containing protein  55.43 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.457563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1441  molybdopterin binding domain-containing protein  55.81 
 
 		 275 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2077  hypothetical protein  57.47 
 
 		 269 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1108  molybdopterin binding domain protein  55.06 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3580  molybdopterin binding domain-containing protein  60 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1806  molybdopterin binding domain-containing protein  56.04 
 
 		 274 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2781  molybdopterin binding domain-containing protein  51.83 
 
 		 302 aa  251  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1180  molybdopterin binding domain protein  53.94 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0357  molybdopterin binding domain-containing protein  49.05 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0528252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3424  molybdopterin binding domain-containing protein  50.78 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000022543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  49.43 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  48.1 
 
 		 248 aa  222  6e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  44.75 
 
 		 248 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  47.08 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  45.85 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  41.09 
 
 		 260 aa  185  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0044  molybdopterin binding domain protein  41.31 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1894  hypothetical protein  39.23 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1568  molybdopterin binding domain  39.23 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557725 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  41.05 
 
 		 251 aa  145  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0651  molybdopterin binding domain protein  33.58 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0438465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  34.1 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  32.41 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  36.31 
 
 		 240 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  34.11 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  28.74 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  31.1 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  31.98 
 
 		 242 aa  96.3  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1090  molybdopterin binding domain-containing protein  33.19 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  34.32 
 
 		 250 aa  95.5  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 256 aa  95.5  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  34.34 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  31.8 
 
 		 412 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  29.82 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  32.28 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  30.73 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  30.3 
 
 		 413 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  30.34 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  30.59 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  33.72 
 
 		 246 aa  89  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  34.52 
 
 		 410 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  35.12 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  35.12 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  33.74 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  33.73 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  33.13 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  32.11 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  33.73 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  28.94 
 
 		 243 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  28.94 
 
 		 243 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  31.19 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  30.86 
 
 		 408 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  34.13 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  29.18 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  31.93 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  28.35 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  28.83 
 
 		 395 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  32.3 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  33.33 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  33.71 
 
 		 408 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  33.14 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.14 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3847  molybdopterin binding domain protein  27.57 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.96 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  32.56 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>