298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2117 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  100 
 
 		 259 aa  510  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  65.85 
 
 		 246 aa  330  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  69.33 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  66.39 
 
 		 250 aa  308  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  66.39 
 
 		 245 aa  305  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  63.11 
 
 		 246 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  67.22 
 
 		 250 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  67.26 
 
 		 245 aa  294  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  61.18 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  56.72 
 
 		 245 aa  265  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  55.83 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  55.65 
 
 		 245 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  55.04 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  53.97 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  52.5 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  52.28 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  54.58 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  54.69 
 
 		 254 aa  244  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  51.87 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  54.2 
 
 		 245 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  51.01 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  53.25 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  51.02 
 
 		 260 aa  235  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  52.86 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  49.79 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  50.2 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  52.65 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  47.93 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  49.16 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  50.63 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  53.3 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  51.68 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  47.52 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  47.52 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  48.94 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  45.6 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  49.37 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  46.94 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  50.43 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  49.78 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3949  molybdopterin binding domain protein  38.6 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0493373  normal  0.0572261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2081  molybdopterin binding domain-containing protein  35.22 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279418  normal  0.0172334 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02400  conserved hypothetical protein  34.05 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1720  molybdopterin binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2217  molybdopterin binding domain protein  37.44 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.132891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2127  molybdopterin binding domain protein  37 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  34.65 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0288  molybdopterin binding domain protein  36.82 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00336657  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  33.77 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  33.59 
 
 		 391 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2333  molybdopterin binding domain protein  33.47 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.651571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  33.2 
 
 		 248 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  33.8 
 
 		 393 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00183  molybdopterin binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11210)  31.92 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  32.65 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  32.18 
 
 		 415 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  31.75 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  33.65 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2617  molybdopterin binding domain  32.02 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  normal  0.647979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  31.17 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  32.79 
 
 		 418 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  30.95 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  36.11 
 
 		 395 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3847  molybdopterin binding domain protein  31.78 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1483  molybdopterin binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1519  hypothetical protein  32.02 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495603  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  29.18 
 
 		 415 aa  99.8  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  31.16 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  33.8 
 
 		 413 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  31.31 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  34.52 
 
 		 412 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2061  molybdopterin binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  31.75 
 
 		 372 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2064  molybdopterin binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  31.95 
 
 		 406 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.1 
 
 		 430 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  30.09 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  31.15 
 
 		 417 aa  93.2  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5926  molybdopterin binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2188  molybdopterin binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2151  molybdopterin binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435728  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2169  molybdopterin binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  30.37 
 
 		 411 aa  92.8  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  28.75 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1842  molybdopterin-binding protein  32.03 
 
 		 272 aa  92.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1120  molybdopterin binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.501454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  32.48 
 
 		 408 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  34.16 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.06 
 
 		 401 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  31.35 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5460  molybdopterin binding protein  30.77 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.67 
 
 		 424 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  26.42 
 
 		 412 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  31.36 
 
 		 419 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2978  molybdopterin binding domain-containing protein  29.24 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  34.97 
 
 		 418 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  30.09 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  31.85 
 
 		 408 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.67 
 
 		 424 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>