More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1923 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  100 
 
 		 167 aa  328  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  69.88 
 
 		 178 aa  220  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1279  CinA-like protein  59.62 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  52.32 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  54.55 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  53.19 
 
 		 184 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  54.55 
 
 		 165 aa  140  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  57.33 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  48.47 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  47.85 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  51.28 
 
 		 208 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  53.19 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  53.19 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  53.19 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  55.7 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  53.19 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  53.21 
 
 		 203 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  54.36 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  51.92 
 
 		 211 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  55.32 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  56.64 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  56.64 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  48.77 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  50.64 
 
 		 208 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  56.64 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  47.85 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  56.55 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  52.86 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  57.34 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  51.83 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  51.83 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1615  CinA domain protein  47.24 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  51.83 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  51.83 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  51.83 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  51.83 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  51.83 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  55.24 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  51.28 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  52.86 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  56.16 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  45.73 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  53.12 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  56.16 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  56.16 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  51.77 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  50.61 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  53.85 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  55.48 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  50.64 
 
 		 206 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  45.12 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  53.57 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  53.96 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  51.06 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  51.06 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  51.06 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  51.06 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  51.06 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  51.06 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  55.47 
 
 		 203 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  51.06 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  55.48 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  52.55 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  46.63 
 
 		 414 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  50.61 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  51.43 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  50.65 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  50.64 
 
 		 202 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  56.2 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  52.29 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  50.31 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  46.58 
 
 		 429 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  52.86 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  61.82 
 
 		 418 aa  127  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  50.34 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  50.34 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  49.66 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  56.03 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  42.86 
 
 		 412 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  50.98 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  55.83 
 
 		 431 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  59.62 
 
 		 411 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  52.17 
 
 		 156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  52.86 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  51.09 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  50.33 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  55 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  50.98 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  45.78 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  48.7 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  53.57 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  44.51 
 
 		 424 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  48.59 
 
 		 420 aa  124  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  51.8 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  54.29 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  44.51 
 
 		 424 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  48.59 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  54.61 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  51.05 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  43.03 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>