More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2833 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  100 
 
 		 161 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  97.52 
 
 		 161 aa  285  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  88.81 
 
 		 157 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  66.03 
 
 		 159 aa  194  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  70.07 
 
 		 140 aa  185  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1579  CinA-like protein  62.75 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0260319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  59.73 
 
 		 166 aa  167  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3665  CinA domain-containing protein  73.64 
 
 		 139 aa  161  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  58.28 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  58.67 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  61.07 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  57.69 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  58.04 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  56.29 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  58 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  56.29 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  56.83 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  61.43 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  57.52 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1911  CinA domain-containing protein  65.54 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.162967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  57.45 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  61.43 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  58.39 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  55.78 
 
 		 208 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  53.69 
 
 		 208 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  57.75 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  61.15 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  55.06 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  52.63 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  56.67 
 
 		 208 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  53.38 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  54.73 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  56.43 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  54.67 
 
 		 206 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  57.89 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  55.41 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  56.85 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  55.15 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  54.73 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  53.59 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  58.55 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  55.15 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  55.15 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1615  CinA domain protein  56.25 
 
 		 166 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  55.4 
 
 		 168 aa  133  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  54.42 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  54.05 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  54.05 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  54.05 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  54.05 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  54.05 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  54.05 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  55.1 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  54.05 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  56.92 
 
 		 420 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  55.26 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  55.56 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  51.9 
 
 		 202 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  51.68 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  51.68 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  54.05 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  51.75 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  52.94 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  54.19 
 
 		 175 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  54.17 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  53.74 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  53.74 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  56.83 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  54.55 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  56.39 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  47.1 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  53.06 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  48.98 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  54.41 
 
 		 176 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  55.77 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  54.55 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  48.3 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  48.15 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  48.15 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  48.15 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  56.92 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  52.45 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  54.14 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  48.15 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  48.15 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  48.15 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  48.15 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  46.75 
 
 		 411 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  53.96 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  50.34 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  48.15 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  51.28 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  51.28 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  51.28 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  52.11 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  54.17 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  50.35 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  57.45 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  50.64 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>