More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0852 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  100 
 
 		 275 aa  560  1.0000000000000001e-159  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  42.69 
 
 		 408 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  42.69 
 
 		 408 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  39.2 
 
 		 413 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  40.94 
 
 		 411 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  45.28 
 
 		 418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  37.68 
 
 		 412 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  40.8 
 
 		 412 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  43.42 
 
 		 403 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  44.07 
 
 		 401 aa  125  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  39.76 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  45.03 
 
 		 184 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  39.64 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  43.12 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  45.03 
 
 		 162 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  45.03 
 
 		 162 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  47.1 
 
 		 140 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  36.09 
 
 		 400 aa  122  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  47.18 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  47.18 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  47.18 
 
 		 166 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  41.4 
 
 		 165 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  41.4 
 
 		 165 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  41.4 
 
 		 165 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  41.4 
 
 		 165 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  41.4 
 
 		 165 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  41.4 
 
 		 165 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  41.4 
 
 		 165 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  41.4 
 
 		 165 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.38 
 
 		 433 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  39.05 
 
 		 420 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  42.04 
 
 		 166 aa  122  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  46.48 
 
 		 166 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  46.48 
 
 		 166 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  46.48 
 
 		 166 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  46.48 
 
 		 166 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  46.48 
 
 		 166 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  46.48 
 
 		 166 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  46.48 
 
 		 166 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  46.48 
 
 		 166 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.4 
 
 		 424 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  45.77 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  41.4 
 
 		 165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  38.6 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  36.26 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  45.77 
 
 		 184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  45.77 
 
 		 166 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  40.76 
 
 		 165 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  40.76 
 
 		 165 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  46.48 
 
 		 166 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  40.76 
 
 		 165 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  46.85 
 
 		 161 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  46.15 
 
 		 161 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  35.47 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  44.37 
 
 		 173 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  40.13 
 
 		 165 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  44.7 
 
 		 156 aa  117  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  43.31 
 
 		 424 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  40.13 
 
 		 165 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  37.11 
 
 		 415 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  44.44 
 
 		 203 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  43.97 
 
 		 166 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  43.26 
 
 		 166 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  44.08 
 
 		 162 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  41.33 
 
 		 166 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  41.56 
 
 		 160 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  47.24 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  41.94 
 
 		 166 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  58 
 
 		 157 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  39.75 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  39.76 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  38.46 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  41.4 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  38.17 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  43.79 
 
 		 159 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  41.84 
 
 		 166 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  43.23 
 
 		 160 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  44.23 
 
 		 417 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  42.57 
 
 		 159 aa  112  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  39.26 
 
 		 414 aa  112  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.67 
 
 		 431 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  41.18 
 
 		 364 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0492  competence/damage-inducible protein cinA  35.2 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  36.69 
 
 		 414 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  36.16 
 
 		 430 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  43.24 
 
 		 165 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  36.84 
 
 		 422 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  41.1 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  38.22 
 
 		 411 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  37.93 
 
 		 420 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  50.34 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  41.83 
 
 		 162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  42.5 
 
 		 165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  36 
 
 		 422 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  41.61 
 
 		 166 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  42.47 
 
 		 165 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1911  CinA domain-containing protein  46.38 
 
 		 157 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.162967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.75 
 
 		 408 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  40.94 
 
 		 166 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  36.14 
 
 		 415 aa  109  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>