More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0833 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  100 
 
 		 156 aa  302  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  51.92 
 
 		 429 aa  152  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  49.31 
 
 		 415 aa  151  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  48.61 
 
 		 415 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  44.59 
 
 		 218 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  55.3 
 
 		 413 aa  148  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  53.57 
 
 		 413 aa  147  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  48.59 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 408 aa  145  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  51.03 
 
 		 412 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  50.34 
 
 		 412 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  46.94 
 
 		 400 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  52.82 
 
 		 419 aa  142  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  49.67 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  49.32 
 
 		 408 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  45.75 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  48.99 
 
 		 423 aa  140  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  52.14 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  48.65 
 
 		 420 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  46.81 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  44.14 
 
 		 413 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  48.61 
 
 		 420 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  49.31 
 
 		 411 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  44.16 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  51.61 
 
 		 163 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  51.88 
 
 		 413 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  46.48 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  45.45 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  51.13 
 
 		 408 aa  135  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  48.65 
 
 		 418 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  46.98 
 
 		 411 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  46 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  45.7 
 
 		 181 aa  134  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  49.67 
 
 		 423 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  46.62 
 
 		 420 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  47.55 
 
 		 169 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  47.95 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0482  CinA domain protein  49.31 
 
 		 369 aa  132  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  45.52 
 
 		 413 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  48.89 
 
 		 423 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  45.14 
 
 		 415 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  44.22 
 
 		 403 aa  131  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  47.48 
 
 		 432 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  48.12 
 
 		 415 aa  130  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  50.81 
 
 		 417 aa  130  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  46.98 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  41.5 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  47.55 
 
 		 184 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  46.48 
 
 		 417 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  44.67 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  42.95 
 
 		 431 aa  128  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  46.15 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  47.55 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  44 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  47.55 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  44.68 
 
 		 437 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  44.23 
 
 		 196 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  41.72 
 
 		 436 aa  127  8.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  47.73 
 
 		 418 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  44 
 
 		 165 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  46.97 
 
 		 423 aa  127  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  46.92 
 
 		 416 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  52.21 
 
 		 424 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  48.15 
 
 		 401 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  45.64 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  42.95 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  47.33 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  48.18 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  48.18 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  45.95 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  46.26 
 
 		 413 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  41.38 
 
 		 413 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  43.33 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  41.38 
 
 		 414 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  43.62 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  44.52 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  42.28 
 
 		 166 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  45.32 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  42.65 
 
 		 414 aa  123  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  43.45 
 
 		 415 aa  123  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  44.85 
 
 		 411 aa  123  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  43.36 
 
 		 412 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  43.36 
 
 		 184 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  42.28 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  45.45 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  44.83 
 
 		 418 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 416 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  44.14 
 
 		 203 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 416 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  44.3 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>