More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1660 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  100 
 
 
162 aa  319  9.000000000000001e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  52.35 
 
 
163 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  49.35 
 
 
162 aa  130  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  50.34 
 
 
414 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  50.96 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  47.59 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  48.63 
 
 
173 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  46.9 
 
 
166 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  47.13 
 
 
166 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  42.28 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  46.9 
 
 
184 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  46.9 
 
 
166 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  48.91 
 
 
415 aa  124  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  48.97 
 
 
414 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  48.45 
 
 
218 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  46.5 
 
 
166 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  46.84 
 
 
164 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  48.59 
 
 
175 aa  122  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  45.32 
 
 
156 aa  123  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  47.1 
 
 
413 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  48.91 
 
 
165 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  47.74 
 
 
168 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  50.69 
 
 
169 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  49.32 
 
 
156 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3262  CinA-like  45.45 
 
 
170 aa  121  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  46.54 
 
 
166 aa  121  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  46.21 
 
 
179 aa  120  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  47.4 
 
 
159 aa  121  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  44.65 
 
 
166 aa  120  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  44.94 
 
 
436 aa  120  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  47.06 
 
 
166 aa  120  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  46.21 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  43.87 
 
 
413 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  45.21 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  46.21 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  46.21 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  46.21 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  50.96 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  51.72 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  47.68 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  45.52 
 
 
165 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  44.94 
 
 
161 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  45.52 
 
 
165 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  45.52 
 
 
165 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  41.1 
 
 
412 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  39.88 
 
 
401 aa  118  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  47.83 
 
 
415 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  48.37 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  48.61 
 
 
420 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  45.21 
 
 
408 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  44.6 
 
 
415 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  42.67 
 
 
371 aa  117  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  46.45 
 
 
174 aa  117  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  40.41 
 
 
412 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  47.65 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.429483 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  45.58 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  45.58 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  45.58 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  45.58 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  45.58 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  49.04 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  45.58 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  44.83 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  45.58 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  47.13 
 
 
418 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  45.95 
 
 
165 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  50.36 
 
 
160 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  39.71 
 
 
411 aa  115  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  44.14 
 
 
419 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  46.21 
 
 
413 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  46.72 
 
 
165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  47.37 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  52.31 
 
 
165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  43.79 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  46.2 
 
 
166 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  44.79 
 
 
166 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  44.3 
 
 
160 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  43.83 
 
 
200 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  40.41 
 
 
403 aa  114  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  38.96 
 
 
415 aa  114  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1656  CinA domain-containing protein  45.62 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  44.59 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  48.37 
 
 
208 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  43.87 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  44.9 
 
 
420 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  41.36 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  46.48 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0482  CinA domain protein  44.06 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  41.77 
 
 
165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  46.58 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  42.76 
 
 
362 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  46.41 
 
 
211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  44.36 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  46.41 
 
 
208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  43.45 
 
 
166 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  44.76 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  46.41 
 
 
431 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  39.04 
 
 
416 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  44.76 
 
 
184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  44.76 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>