More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3194 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  310  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  47.77 
 
 
415 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  46.15 
 
 
432 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  48.34 
 
 
415 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 
412 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  45.39 
 
 
413 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  44.87 
 
 
411 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  47.33 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  46.91 
 
 
420 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  52.1 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  46.45 
 
 
211 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  50.74 
 
 
168 aa  124  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  46.45 
 
 
208 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  48.74 
 
 
411 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  41.56 
 
 
412 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  44.44 
 
 
413 aa  121  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  50 
 
 
160 aa  121  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  47.4 
 
 
162 aa  121  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  39.1 
 
 
408 aa  120  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  48.55 
 
 
414 aa  120  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  44.68 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  47.4 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  45.51 
 
 
413 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  39.1 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  43.51 
 
 
203 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  47.62 
 
 
162 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  48.99 
 
 
434 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  42.68 
 
 
164 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  46.45 
 
 
431 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  59.26 
 
 
447 aa  118  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  44.87 
 
 
206 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  45.91 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  49.32 
 
 
417 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  50.42 
 
 
415 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  42.76 
 
 
414 aa  117  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  48.41 
 
 
421 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  44.52 
 
 
202 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  44.87 
 
 
412 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  48.39 
 
 
423 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  42.58 
 
 
163 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  42.31 
 
 
208 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  47.17 
 
 
416 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  44.6 
 
 
163 aa  114  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  43.71 
 
 
416 aa  114  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  46.1 
 
 
169 aa  114  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  48.51 
 
 
414 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.86 
 
 
433 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  47.17 
 
 
416 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  39.24 
 
 
423 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  55.24 
 
 
420 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  45.52 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  51.67 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  41.67 
 
 
208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  42.76 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  44.03 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  46.97 
 
 
424 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  47.1 
 
 
413 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  48.1 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  42.95 
 
 
169 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  43.31 
 
 
165 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  46.58 
 
 
418 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  40.67 
 
 
411 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  39.61 
 
 
414 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  42.5 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  46.77 
 
 
424 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  40.61 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  46.1 
 
 
413 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  53.7 
 
 
423 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  43.51 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  50.93 
 
 
413 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  42.5 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  41.06 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  41.29 
 
 
166 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  39.6 
 
 
412 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  39.6 
 
 
412 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  39.6 
 
 
412 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  39.6 
 
 
412 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  45.28 
 
 
169 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  39.6 
 
 
412 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  42.68 
 
 
165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  39.6 
 
 
412 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  43.44 
 
 
413 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  43.36 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  39.6 
 
 
412 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  40.37 
 
 
419 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  46.72 
 
 
430 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  47.79 
 
 
426 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  40.91 
 
 
168 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  40.65 
 
 
166 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  42.28 
 
 
179 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  36.36 
 
 
275 aa  107  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  41.25 
 
 
420 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  46.72 
 
 
430 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  40.76 
 
 
371 aa  107  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 
417 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  41.94 
 
 
166 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  47.06 
 
 
431 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  43.28 
 
 
156 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  50 
 
 
419 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  47.22 
 
 
168 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.429483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>