More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1074 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  100 
 
 		 169 aa  339  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  90.48 
 
 		 169 aa  303  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  79.88 
 
 		 169 aa  263  7e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  47.17 
 
 		 436 aa  141  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  47.37 
 
 		 415 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  50.69 
 
 		 415 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  49.36 
 
 		 413 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  42.59 
 
 		 415 aa  131  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  46.98 
 
 		 413 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  45.95 
 
 		 420 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  48.57 
 
 		 163 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  46.15 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  47.41 
 
 		 371 aa  128  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  43.92 
 
 		 408 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  43.92 
 
 		 408 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  47.3 
 
 		 420 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44.59 
 
 		 432 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  39.86 
 
 		 400 aa  123  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  46.85 
 
 		 411 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  39.55 
 
 		 413 aa  122  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  44.08 
 
 		 412 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  47.1 
 
 		 418 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  41.22 
 
 		 413 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  43.33 
 
 		 411 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  41.89 
 
 		 413 aa  117  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  43.87 
 
 		 417 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  43.59 
 
 		 420 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  40.36 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  43.59 
 
 		 408 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  43.17 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  44.68 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  46.76 
 
 		 419 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  42.47 
 
 		 417 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  42.77 
 
 		 421 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  40.13 
 
 		 417 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  46.1 
 
 		 159 aa  114  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 423 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  43.84 
 
 		 414 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  36.75 
 
 		 414 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  38.82 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  39.02 
 
 		 418 aa  112  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  37.33 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  42.95 
 
 		 418 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  47.58 
 
 		 413 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  39.61 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  40.79 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  39.51 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  40.13 
 
 		 412 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  42.04 
 
 		 211 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  40.65 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  42.04 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.61 
 
 		 431 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  42.04 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  40.72 
 
 		 208 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  39.26 
 
 		 424 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  39.1 
 
 		 433 aa  107  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  41.14 
 
 		 424 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  47.65 
 
 		 414 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  38.26 
 
 		 218 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  39.47 
 
 		 412 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  40.88 
 
 		 416 aa  105  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  42.68 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  39.87 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  39.87 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  44.53 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  40.85 
 
 		 429 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  36.88 
 
 		 403 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  39.87 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  47.79 
 
 		 423 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  41.4 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  41.18 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  38.06 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  38.89 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  42.47 
 
 		 414 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  37.42 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  44.93 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  41.56 
 
 		 423 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  41.73 
 
 		 411 aa  104  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  41.67 
 
 		 425 aa  104  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  39.35 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  39.88 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  42.04 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  39.88 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  39.1 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  36 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  38.56 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  42.41 
 
 		 431 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  31.03 
 
 		 408 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  38.82 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  36.94 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  39.74 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  45.99 
 
 		 416 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  39.86 
 
 		 447 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  41.29 
 
 		 416 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  37.04 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  41.29 
 
 		 416 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  40.51 
 
 		 438 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  36.18 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  42.86 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  38.82 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>