More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3162 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  100 
 
 		 160 aa  323  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  59.73 
 
 		 420 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  58.97 
 
 		 414 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  57.69 
 
 		 414 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  57.89 
 
 		 413 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  57.89 
 
 		 413 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  54.67 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  57.14 
 
 		 417 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  52.7 
 
 		 420 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  50.99 
 
 		 413 aa  150  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  51.75 
 
 		 420 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  52.35 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  51.8 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  48.92 
 
 		 414 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  50.35 
 
 		 419 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  47.4 
 
 		 413 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  47.86 
 
 		 415 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  46.36 
 
 		 408 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  45.7 
 
 		 408 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  50.99 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  52.52 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  51.77 
 
 		 412 aa  134  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  52.52 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  52.52 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  51.82 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  54.55 
 
 		 408 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  48.97 
 
 		 432 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  51.8 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  51.75 
 
 		 418 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  51.8 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  50.69 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  53.12 
 
 		 419 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  50.69 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  51.41 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  49.01 
 
 		 424 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  56.64 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  51.8 
 
 		 184 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  50.69 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  51.45 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  51.09 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  51.09 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  51.09 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  51.09 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  51.09 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  51.09 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  48.32 
 
 		 418 aa  130  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  51.09 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  52.41 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  51.88 
 
 		 173 aa  130  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  51.08 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  54.55 
 
 		 408 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  45.39 
 
 		 423 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  53.19 
 
 		 410 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  52.52 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  42.96 
 
 		 411 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  41.5 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  51.39 
 
 		 422 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  48.32 
 
 		 179 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  48.48 
 
 		 166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1911  CinA domain-containing protein  57.89 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.162967  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  51.39 
 
 		 422 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  52.59 
 
 		 408 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  48.48 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  50 
 
 		 176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  47.52 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  45.51 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  47.02 
 
 		 411 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  45.51 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  53.54 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  44.29 
 
 		 411 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  49.01 
 
 		 430 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  44.37 
 
 		 156 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  52.31 
 
 		 192 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  45.39 
 
 		 424 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  44.83 
 
 		 413 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  45.39 
 
 		 424 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  45.39 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  45.39 
 
 		 424 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  44.08 
 
 		 424 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  45.65 
 
 		 418 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  44.76 
 
 		 415 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  42.25 
 
 		 413 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  44.74 
 
 		 425 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  45.51 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  48.05 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  45.1 
 
 		 424 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 421 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  43.33 
 
 		 415 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  48.25 
 
 		 421 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  49.64 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 421 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  48.97 
 
 		 436 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 421 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>