More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1725 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  100 
 
 		 160 aa  323  7e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  48.32 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  46.48 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  41.72 
 
 		 403 aa  129  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  45.06 
 
 		 420 aa  128  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  46.25 
 
 		 181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  48.05 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.38 
 
 		 413 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  48.23 
 
 		 218 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  45.89 
 
 		 417 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  43.79 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  45.52 
 
 		 164 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  47.69 
 
 		 423 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  44.65 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  46.15 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  41.76 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  40.94 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  44.94 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  44.74 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  48.09 
 
 		 423 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  43.21 
 
 		 425 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  44.3 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  44.3 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  43.05 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  44.3 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  44.72 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  44.3 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  42.11 
 
 		 415 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  42.11 
 
 		 415 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  46.32 
 
 		 418 aa  117  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  41.83 
 
 		 432 aa  117  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  44.3 
 
 		 415 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.29 
 
 		 430 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  43.12 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 429 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  42.18 
 
 		 408 aa  115  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  41.1 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  45.74 
 
 		 413 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  49.58 
 
 		 437 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  42.24 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  38.22 
 
 		 415 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  42.24 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  42.24 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  44.22 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  41.67 
 
 		 168 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  41.22 
 
 		 413 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  43.54 
 
 		 166 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  41.33 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  46 
 
 		 430 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  44.3 
 
 		 420 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  42.11 
 
 		 416 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  43.54 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  46.15 
 
 		 179 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  41.61 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  43.97 
 
 		 417 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  42.14 
 
 		 400 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  41.73 
 
 		 413 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  43.54 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  41.33 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  41.33 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  40.79 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  41.33 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  41.33 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  42.68 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  47.73 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  41.33 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  41.01 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  41.33 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  41.33 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  44.06 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  41.86 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  44.06 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  41.91 
 
 		 417 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  41.61 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  42.24 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  44.06 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  44.54 
 
 		 416 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  44.54 
 
 		 416 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  40.97 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  43.88 
 
 		 413 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1746  competence damage-inducible protein A  41.5 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00125275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2121  competence damage-inducible protein A  41.5 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000221747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  41.18 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  41.61 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  41.61 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  41.61 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  41.61 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  41.33 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  40.79 
 
 		 418 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  40.13 
 
 		 415 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  45.97 
 
 		 425 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  45.97 
 
 		 425 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  41.61 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  41.61 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  41.61 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01496  competence damage-inducible protein A  40.54 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000206349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  42 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  41.67 
 
 		 412 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01507  hypothetical protein  40.54 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000417567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2153  competence damage-inducible protein A  40.82 
 
 		 172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0198899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>