More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1118 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  100 
 
 
181 aa  360  8e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  87.5 
 
 
172 aa  296  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  62.5 
 
 
172 aa  211  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  61.18 
 
 
171 aa  206  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  57.86 
 
 
196 aa  181  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  48.52 
 
 
420 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  45.7 
 
 
156 aa  134  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  48.17 
 
 
218 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  50.32 
 
 
413 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  46.5 
 
 
415 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  48.1 
 
 
432 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  48.37 
 
 
413 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  43.9 
 
 
419 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  48.65 
 
 
420 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  45.75 
 
 
417 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  50 
 
 
431 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  49.32 
 
 
414 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  46.84 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.41 
 
 
413 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  46.25 
 
 
160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  49.32 
 
 
414 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  47.68 
 
 
419 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  43.92 
 
 
415 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  45.91 
 
 
166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  45.1 
 
 
412 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  45.39 
 
 
160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  43.23 
 
 
160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  56.3 
 
 
437 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 
408 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  46.45 
 
 
429 aa  124  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 
408 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  43.62 
 
 
413 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  45.62 
 
 
174 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  48.59 
 
 
416 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  42.01 
 
 
161 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  40.24 
 
 
412 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  45.28 
 
 
166 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  43.31 
 
 
166 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  39.64 
 
 
412 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  42.59 
 
 
162 aa  121  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  42.59 
 
 
162 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  48.67 
 
 
179 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 
410 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  39.13 
 
 
164 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  44.94 
 
 
416 aa  120  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  42.58 
 
 
413 aa  120  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  47.92 
 
 
164 aa  121  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  41.06 
 
 
408 aa  120  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  41.98 
 
 
166 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 
425 aa  120  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  41.98 
 
 
166 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  39.51 
 
 
166 aa  120  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  40.48 
 
 
166 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.65 
 
 
430 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  46.72 
 
 
424 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  40.48 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 
413 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 
425 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 
425 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  41.98 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  39.88 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 
424 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  39.88 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  39.88 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  40.4 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  43.35 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  39.88 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  43.03 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  40.59 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  42.41 
 
 
424 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  41.98 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3262  CinA-like  40.49 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  41.98 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  39.88 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  39.88 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  39.88 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  39.88 
 
 
166 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  45.39 
 
 
166 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  51.91 
 
 
425 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  44.9 
 
 
424 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  49.18 
 
 
419 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 
424 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  40.59 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  38.61 
 
 
164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  41.42 
 
 
165 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  41.42 
 
 
165 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  41.94 
 
 
160 aa  118  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  41.42 
 
 
165 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  41.42 
 
 
165 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  44.65 
 
 
166 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  50.35 
 
 
168 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  40 
 
 
430 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  38.82 
 
 
169 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  42.41 
 
 
424 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  43.67 
 
 
413 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  44.3 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  45.81 
 
 
163 aa  117  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  47.93 
 
 
424 aa  117  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  40.12 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  43.87 
 
 
416 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>