More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01496 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01496  competence damage-inducible protein A  100 
 
 		 172 aa  353  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000206349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2108  CinA domain protein  100 
 
 		 172 aa  353  7.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000498834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01507  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  353  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000417567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2153  competence damage-inducible protein A  98.84 
 
 		 172 aa  349  8.999999999999999e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0198899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1746  competence damage-inducible protein A  98.26 
 
 		 172 aa  346  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00125275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2121  competence damage-inducible protein A  98.15 
 
 		 172 aa  329  9e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000221747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1703  competence damage-inducible protein A  97.55 
 
 		 172 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0296412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1627  competence damage-inducible protein A  96.93 
 
 		 172 aa  325  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000853954  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1617  competence damage-inducible protein A  61.49 
 
 		 175 aa  210  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1685  competence damage-inducible protein A  60.25 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1626  competence damage-inducible protein A  60.25 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1657  competence damage-inducible protein A  60.25 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000815858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1823  competence damage-inducible protein A  59.63 
 
 		 175 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.617319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3132  competence damage-inducible protein A  56.21 
 
 		 174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  43.56 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  43.14 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  42 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  38.85 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  39.02 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  41.94 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  38.6 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  40.54 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  43.88 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  43.17 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  43.17 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  43.17 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  43.17 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  40.13 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  40.13 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  40.13 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  38.51 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  39.74 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  42.45 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  39.62 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  37.42 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  38.51 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  37.42 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  37.42 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  37.42 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  37.58 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  37.74 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  37.42 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  37.42 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  37.89 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  37.42 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  37.42 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  38.36 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  37.74 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  37.42 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  42.04 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  43.17 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  39.74 
 
 		 414 aa  109  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  37.27 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  37.27 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  36.65 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  37.74 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  38.36 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  37.74 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  40.88 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  37.89 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  36.2 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  43.57 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  41.83 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  38.85 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  41.4 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  37.01 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  37.82 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  37.82 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  41.32 
 
 		 432 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  42.36 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  37.11 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  38.13 
 
 		 164 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  41.96 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  35.22 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  35.22 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  35.22 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  35.22 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  35.22 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  35.22 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  35.22 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  35.22 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  35.67 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  37.66 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  37.65 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3262  CinA-like  36.54 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  37.58 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  38.56 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  36.6 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  36.6 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  36.48 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  37.58 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  35.95 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  36.5 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  34.21 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  36.54 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  39.57 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3003  CinA domain-containing protein  40.56 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  40.83 
 
 		 430 aa  99.4  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  34.78 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1230  CinA domain-containing protein  35.9 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000125807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>